如果作废了专项扣除后，计算出的补缴税额不超过400元，那么根据相关规定，通常是不需要补缴的。以下是对此问题的详细分析：
法规依据
根据税法相关规定，对于个人所得税的补缴，通常会设定一个阈值，即当补缴税额低于这个阈值时，可以免于补缴。这个阈值的具体数额可能会因地区、时间或政策调整而有所变化，但根据你提供的信息，我们可以合理推断，在你所描述的情况下，400元很可能是这个阈值或者低于这个阈值。
实际操作
核查计算：首先，你需要确保你的计算是准确的。作废专项扣除后，重新计算应缴税额，并确定补缴税额确实不超过400元。
关注政策变化：税法政策可能会随时调整，因此建议你关注相关税务部门的官方公告或咨询，以确保你的理解是最新的，并且符合当前的政策规定。
无需补缴的情况：如果你的补缴税额确实不超过规定的阈值（如400元），那么你无需进行补缴操作。
记录备查：尽管不需要补缴，但建议你保留好相关的计算记录和凭证，以备未来可能的核查或审计。
综上所述，根据你所描述的情况和税法的一般规定，如果作废专项扣除后计算出的补缴税额不超过400元，你通常是不需要补缴的。但请务必关注税法的最新动态，并确保你的计算是准确的。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。