针对“风景名胜区用地违规由谁处理”的问题，以下是我给出的详细解答：
首先，我们需要明确的是，风景名胜区作为具有特殊保护价值的区域，其用地管理受到严格的法律法规约束。当发生用地违规行为时，处理主体和责任划分主要依据相关法律法规及政策文件。
一、处理主体
风景名胜区管理机构：
- 根据《风景名胜区条例》的相关规定，风景名胜区管理机构在保护和管理风景名胜区方面承担着重要职责。对于个人或单位在风景名胜区内进行的违规用地行为，如开荒、修坟立碑、设置商业广告、举办大型游乐活动等，风景名胜区管理机构有权责令停止违法行为，限期恢复原状或采取其他补救措施，并处以相应的罚款。
自然资源部门：
- 自然资源部门作为土地管理的主管部门，对风景名胜区的用地情况也负有监管职责。在发现用地违规行为后，自然资源部门可以依法进行调查处理，包括责令恢复土地原状、没收违法所得、罚款等，并可将案件线索移交相关部门进行进一步处理。
政府及相关部门：
- 在某些情况下，如风景名胜区用地违规行为涉及政府决策或政府部门的失职行为，政府及相关部门也需要承担相应的责任。例如，政府未依法履行用地审批手续，或相关部门未认真履行监管职责等，都可能导致用地违规行为的发生。此时，政府及相关部门需要依法依规进行整改，并对相关责任人员进行追责问责。
二、处理流程
发现与报告：
- 当发现风景名胜区存在用地违规行为时，相关机构或个人应及时向风景名胜区管理机构或自然资源部门报告。
调查与处理：
- 风景名胜区管理机构或自然资源部门在接到报告后，应依法进行调查处理。包括现场勘查、询问当事人、收集证据等，并根据调查结果作出相应的处理决定。
整改与落实：
- 对于被责令整改的用地违规行为，相关单位或个人应按要求进行整改，并恢复原状或采取其他补救措施。同时，风景名胜区管理机构或自然资源部门应加强对整改情况的跟踪检查，确保整改措施得到有效落实。
追责与问责：
- 对于涉及政府决策或政府部门失职的用地违规行为，应依法依规进行追责问责。包括对相关责任人员进行行政处分、党纪处分等，并公开通报处理结果。
综上所述，风景名胜区用地违规的处理主体主要包括风景名胜区管理机构、自然资源部门以及政府及相关部门。在处理流程上，需要依次进行发现与报告、调查与处理、整改与落实以及追责与问责等步骤。通过严格的法律法规约束和有效的监管措施，我们可以共同保护风景名胜区的自然环境和文化遗产。