针对您提出的“违规使用医保6万多元一旦查出来犯罪人被关押脏款罚金怎么交”的问题，以下是我的详细解答：
首先，需要明确的是，违规使用医保基金是违法行为，一旦查出，将依法追究相关责任人的法律责任。根据您描述的情况，如果犯罪人因违规使用医保6万多元被查处并关押，那么其涉及的脏款（即违规使用的医保基金）和可能的罚金都需要依法处理。
关于脏款的处理：
追回与退缴：一旦违规使用医保基金的行为被确认，相关部门（如医保局、公安机关等）会要求犯罪人退回违规使用的医保基金。如果犯罪人主动退缴全部或部分脏款，这通常会在法律判决中作为量刑的考虑因素之一。
法律程序：如果犯罪人不主动退缴脏款，相关部门将通过法律程序（如民事诉讼、刑事追诉等）来追回这笔款项。这可能包括冻结犯罪人的银行账户、查封其财产等措施，以确保脏款能够被追回并用于弥补医保基金的损失。
关于罚金的处理：
判决与执行：如果犯罪人被法院判定有罪，并需要支付罚金，那么罚金将作为刑罚的一部分由法院进行判决。判决后，犯罪人需要按照判决要求的时间和方式支付罚金。
强制执行：如果犯罪人不按时支付罚金，法院有权采取多种强制执行措施，如冻结银行账户、查封财产等，以确保罚金能够得到及时支付。
综上所述，违规使用医保基金一旦查出并导致犯罪人被关押，其涉及的脏款和罚金都需要依法处理。脏款通常会被追回并用于弥补医保基金的损失，而罚金则作为刑罚的一部分由法院进行判决并执行。在处理这些款项时，相关部门会遵循法律程序，并确保款项的合法性和公正性。