非法经营罪退赃退款的处理方式主要涉及以下几个步骤和注意事项：
一、退赃流程
向公安机关说明情况：
- 犯罪嫌疑人需要主动向公安机关投案，并详细说明非法经营的情况，包括经营的内容、时间、地点、涉及的金额以及赃款赃物的具体去向等。
交待犯罪事实：
- 如实供述自己的罪行，不隐瞒、不歪曲事实，以便公安机关能够全面了解案件情况。
提交退赃说明：
- 撰写退赃说明，明确表明自己愿意退赃退款的意愿，并说明退赃的具体方式和金额。
交纳赃款：
- 根据公安机关的指示，将赃款交至指定账户或地点。如果赃款已经用于其他用途或无法全额退还，需要向公安机关说明情况，并尽力筹集资金进行退还。
二、退赃的认定与处理
司法机关认定：
- 退赃的相关情况将由司法机关根据相关法律法规进行认定。如果认定犯罪嫌疑人确实存在退赃行为，且退赃态度积极、金额较大，这将对量刑产生积极影响。
影响量刑情节：
- 退赃是量刑时考虑的一个重要因素。如果犯罪嫌疑人能够积极退赃，结合其犯罪情节和悔罪表现，司法机关可能会给予从轻或减轻处罚。相反，如果无法退还赃款或退赃态度不积极，可能会影响量刑结果。
三、注意事项
把握时间节点：
- 在公安机关第一次联系你配合调查时，就应积极表明退赃意愿，并尽快采取行动。如果已经被抓捕归案，应在侦查阶段尽快与检察官沟通退赃事宜，争取取保候审的机会。
全额退赃：
- 尽可能全额退还赃款，以体现自己的悔罪态度。如果确实无法全额退还，也应尽力筹集资金进行部分退还，并说明无法全额退还的原因。
配合调查：
- 在整个退赃过程中，要积极配合公安机关的调查工作，如实提供相关信息和证据，以便司法机关能够准确认定退赃情况。
综上所述，非法经营罪退赃退款是一个涉及多个环节和注意事项的过程。犯罪嫌疑人需要积极向公安机关投案并说明情况、交待犯罪事实、提交退赃说明并交纳赃款。同时，要注意把握时间节点、全额退赃并配合调查工作，以便司法机关能够准确认定退赃情况并给予从轻或减轻处罚。