公司迟到扣钱是否合理，需根据具体情况和相关法律法规综合判断，关键在于公司规章制度的制定和执行是否合法合规，以及扣罚措施是否合理。以下从不同角度为您详细分析：

一、合法情况

1. 规章制度明确且合法

   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
   • 解析：如果公司通过民主程序制定了关于迟到扣钱的规章制度，内容不违反法律法规的强制性规定，并且已经向员工进行了公开公示或告知，那么公司依据该规章制度对迟到员工进行合理扣钱，是行使用工自主权的体现，不违反法律。

2. 劳动合同有约定

   • 解析：若劳动合同中明确约定了迟到扣钱的标准，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么按照约定扣钱也是合法的。

3. 扣除金额合理

   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。同时，若因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失，用人单位可按劳动合同约定要求劳动者赔偿，但扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
   • 解析：公司扣罚迟到员工的金额应当合理，不能过高，要与员工的迟到情节、给公司造成的损失等因素相适应。如果扣罚金额过高，导致劳动者工资明显不合理减少，甚至低于当地最低工资标准，或扣除比例显失公平，则公司的扣钱行为可能违反法律。

二、不合法情况

1. 缺乏规章制度或未公示

   • 解析：若公司未依法制定关于迟到扣钱的规章制度，或制定了但未进行公开公示并告知员工，则对迟到员工的扣钱行为可能不合法。

2. 扣罚金额不合理

   • 解析：如前所述，若扣罚金额过高，导致劳动者工资明显不合理减少，甚至低于当地最低工资标准，或扣除比例显失公平，则公司的扣钱行为可能违反法律。

3. 特殊情况下的迟到

   • 解析：若员工因不可抗力等合理原因导致迟到，如自然灾害、交通意外等，公司仍扣工资则不合理，应考虑实际情况予以豁免或减轻处罚。

三、劳动者权益保护

• 解析：劳动者认为用人单位的迟到扣工资规定不合理或存在违法情况时，可通过协商、申请调解、仲裁或提起诉讼等方式维护自己的合法权益。例如，劳动者可以先与公司进行协商，看是否能够达成一致意见；如果协商不成，可以向当地的劳动争议调解组织申请调解；如果调解不成，还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。

四、建议

1. 对于公司：在制定和执行关于迟到扣钱的规章制度时，应确保内容合法、合理，并已进行公开公示告知员工。同时，扣罚金额应合理，不能过高，且扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。
2. 对于员工：应了解公司的规章制度和劳动合同中的相关约定，遵守劳动纪律，尽量避免迟到。如果因特殊原因迟到，应及时与公司沟通并说明情况。如果认为公司的扣钱行为不合理或违法，可以通过合法途径维护自己的权益。

总之，公司迟到扣钱的合法性需综合考虑规章制度的制定和执行是否符合法律规定、扣罚措施是否合理等因素。如果您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。