结论前置：老板用微信发工资，在符合一定条件下是合法的。以下是对此问题的详细分析：
合法性分析
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。微信支付作为一种电子支付方式，技术上满足货币支付的要求。
- 《中华人民共和国劳动合同法》及国内各省市地区发布的工资条例规定，用人单位应按时足额给员工发放工资，但并未明确规定具体支付方式。因此，若双方达成协议，且支付过程安全可追溯，微信发工资可视为合法。
双方约定：
- 劳动合同中如明确约定可通过微信转账发放工资，则该行为合法。建议劳动合同中详细列明工资支付方式及相关细节，以避免后续纠纷。
潜在问题与注意事项
证明力问题：
- 微信记录虽可作为证据，但与银行转账相比，在证明款项性质（明确为工资）方面可能较弱。建议在微信转账留言或聊天记录中注明“工资”用途，以增强证据的证明力。
- 取证和认证过程可能复杂，必要时可能需要第三方（如腾讯公司）配合提供支付证明。
税务合规性：
- 无论通过何种方式发放工资，企业都应如实申报并缴纳税款。微信发工资需确保税务申报的合规性，避免逃税嫌疑。
- 用人单位应依法履行代扣代缴个人所得税等义务，确保社保、个税缴纳基数准确。
操作建议：
- 为确保资金安全性和便于管理，建议优先通过正规银行渠道发放工资。银行转账具有更高的安全性和可追溯性，有助于减少潜在风险。
- 如选择微信转账，应与腾讯公司保持沟通，以便必要时提供支付证明。同时，应妥善保存微信转账记录和相关聊天记录，以备不时之需。
特殊规定与地区差异：
- 特殊行业或对资金管理有严格要求的企业，需遵循特定财务制度和规定，可能不能仅通过微信发放工资。这些企业应遵守相关行业的特殊规定，确保工资发放的合规性。
- 不同地区对工资发放的具体规定可能有所差异，用人单位应遵守当地相关规定。例如，某些地区可能要求工资必须通过银行转账方式发放，以确保资金的安全性和可追溯性。
综合建议
虽然微信发工资在一定条件下合法且便捷，但为保障双方权益，减少潜在风险，建议用人单位优先考虑通过正规银行渠道发放工资。同时，应完善劳动合同中的工资支付条款，明确支付方式、时间、金额等细节，确保支付的合法性与安全性。在选择支付方式时，应充分考虑税务合规性、证据保留以及操作便利性等因素。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。