结论：九月底请假是否影响国庆期间带薪假期的工资，需分情况讨论，具体如下：

1. 若请假未被批准或属于合理事假
   根据《企业职工带薪年休假实施办法》及《劳动法》相关规定，国庆节（10月1日至3日）为法定节假日，属于带薪假期，即使员工在九月底请假，只要请假未被认定为旷工或违反公司规章制度，国庆期间的法定节假日工资仍应全额发放。
   若请假属于合理事假（如病假、婚假等），且符合公司制度，国庆带薪假期工资不受影响；但若请假被认定为旷工或违反公司考勤规定，公司可能依据规章制度扣除相应工资，但法定节假日工资仍需支付。

2. 若请假属于调休或年休假
   若员工在九月底使用调休或年休假请假，且国庆期间未安排工作，国庆法定节假日（10月1日至3日）的工资仍需全额支付，其余假期（如调休或年休假部分）按正常工资标准发放。
   若公司安排员工在国庆期间加班，则需按照《劳动法》规定支付加班费（法定节假日300%工资，休息日200%工资），与九月底请假无关。

3. 若公司规章制度有特殊规定
   部分公司可能在规章制度中约定“请假超过一定天数则取消带薪假期”，但此类规定需符合《劳动合同法》第四条的民主程序（如经职工代表大会讨论、公示等），且不得违反法律强制性规定（如法定节假日必须带薪）。
   若公司规章制度未依法制定或违反法律，员工有权拒绝扣除国庆带薪工资，并可向劳动监察部门投诉。

建议：

• 核对公司规章制度，确认请假性质及国庆假期工资支付规则；
  
• 保留请假申请、工资条等证据，若公司无故扣发工资，可依法申请劳动仲裁；
  
• 如有疑问，可直接向我咨询具体操作流程。