工程变更最终确认签字确认，在符合法定程序和合同约定的情况下，是符合法律程序的。以下从多个角度对此问题进行分析：
一、法定程序角度
工程变更的合法性：
- 工程变更通常涉及合同内容的修改，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同内容的变更需要双方协商一致，并可以采用书面形式。因此，工程变更的合法性首先取决于双方是否就变更内容达成了一致意见。
签字确认的法律效力：
- 签字确认是双方就工程变更内容达成一致意见的一种表现形式。在法律上，签字通常被视为对合同或协议内容的认可和接受，具有法律效力。因此，如果工程变更已经过双方协商一致，并最终以签字确认的方式固定下来，那么这种确认方式在法律上是有效的。
二、合同约定角度
合同中的变更条款：
- 建设工程合同中通常会包含关于工程变更的条款，这些条款会规定变更的程序、方式以及双方的权利和义务。如果合同中明确规定了工程变更需要双方签字确认，那么签字确认就是符合合同约定的法律程序。
遵循合同约定的重要性：
- 遵循合同约定是维护合同秩序和保障双方权益的基础。如果工程变更没有按照合同约定的程序进行，可能会导致变更无效或引发纠纷。因此，在工程变更过程中，双方应严格遵守合同约定，确保变更的合法性和有效性。
三、实际操作角度
签字确认的流程：
- 在实际操作中，工程变更的签字确认通常涉及多个环节，如变更申请的提出、变更内容的审核、双方协商以及最终签字确认等。这些环节应确保变更内容的准确性和双方意见的一致性。
签字确认的注意事项：
- 签字确认前，双方应仔细阅读变更内容，确保理解并同意其中的条款。
- 签字确认应由具有相应权限的人员进行，以确保变更的合法性和有效性。
- 签字确认后，双方应妥善保管相关文件，以备后续查阅和参考。
四、可能存在的风险及防范
风险：
- 如果工程变更未经双方充分协商或签字确认程序存在瑕疵，可能会导致变更无效或引发纠纷。
- 签字确认的人员如果无权代表公司或项目部进行变更确认，也可能导致变更无效。
防范：
- 在工程变更过程中，双方应加强沟通，确保变更内容的准确性和双方意见的一致性。
- 严格按照合同约定的程序进行变更确认，确保签字确认的合法性和有效性。
- 对签字确认的人员进行权限审查，确保其有权代表公司或项目部进行变更确认。