公司注册时股东没有签字，其合法性需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、股东未签字的法律性质及可能情形
有权代签：
- 若股东因特殊原因（如出差、生病等）无法亲自签字，但事先提供了合法有效的授权委托书，明确委托他人代为签名，则代签行为在法律上可视为股东本人的行为。此时，尽管原始文件上没有股东的亲笔签名，但由于存在合法的授权委托关系，公司注册行为仍然有效。
无权代签：
- 未经股东同意擅自代签，属于无权代理。若事后股东不追认，该代签行为无效。这种情况下，公司注册的合法性将受到质疑，登记机关可能因此撤销公司注册。特别是在涉及公司重大决策或股权纠纷时，注册的有效性可能被重新审查。
冒用签名：
- 故意冒用股东名义签字，不仅属于侵权行为，还可能构成犯罪（如伪造公司印章罪等）。冒用者需承担法律责任，且可能给被冒用者带来严重的法律后果，包括但不限于被错误登记为股东、承担不必要的法律责任和经济风险。
二、股东未签字对公司及股东个人权益的影响
对公司登记效力的影响：
- 若股东未签字或代签不被认可，公司注册的合法性将受到质疑。这可能导致登记机关撤销公司注册，进而影响公司的正常运营和信誉。
对股东个人权益的影响：
- 未签字的股东可能被错误登记为股东，从而需承担不必要的法律责任和经济风险。例如，他们可能被要求履行出资义务、参与公司决策等，而这些义务和责任原本并非他们所愿意承担的。
- 同时，未签字的股东在公司中的权益（如分红权、表决权等）也可能受到损害。因为他们未在注册文件中签字，可能被视为未同意成为公司股东，从而无法享受相应的股东权益。
三、可能的解决途径
协商解决：
- 发现未签字问题后，应首先尝试与其他股东或公司实际控制人协商，指出代签或冒用签名的问题，并要求重新办理相关手续，补正签字瑕疵。这是最为直接和高效的解决方式。
行政途径：
- 若协商不成，股东可向公司登记机关反映情况，提交证据申请撤销公司登记或对登记事项进行更正。登记机关将依据具体情况进行调查处理，并可能要求公司提供相关证据来证明注册的合法性。
司法途径：
- 在极端情况下，股东还可通过提起确认合同无效之诉、姓名权侵权之诉等司法程序来维护自己的权益。这需要股东提供充分的证据来证明代签或冒用签名的行为存在，并请求法院确认相关文件的效力或追究侵权人的法律责任。
四、建议与风险提示
- 确保股东签字：在公司注册过程中，务必确保所有必要的股东均完成签字手续。这是保障公司注册合法性和股东权益的基础。
- 准备授权委托手续：对于因特殊情况无法亲自签名的股东，应提前准备好合法的授权委托手续，以避免后续可能出现的法律纠纷和风险。
- 及时咨询专业律师：若在公司注册过程中遇到任何疑问或不确定的情况，应及时向我咨询，以确保公司注册的合法性和有效性。
综上所述，公司注册时股东没有签字的合法性需根据具体情况来判断。为避免潜在的法律风险和后续麻烦，建议尽快与未签字股东取得联系，了解其未签字的具体原因，并采取相应措施加以解决。