合作社的公章并不必然归法人保管，其保管主体需根据合作社的实际情况和相关规定来确定。以下是对这一问题的详细分析：

1. 公章保管的法律规定：

   • 在法律上，对于合作社公章的保管并没有明确统一的规定。公章的保管通常依据合作社章程、内部管理制度或相关协议来确定。这意味着，合作社可以根据自身的运营模式和治理结构，灵活安排公章的保管方式。

2. 公章保管的常见方式：

   • 法人保管：法人作为合作社的代表，对合作社的运营和决策负有重要责任。在某些情况下，法人可能会保管公章，以便在需要时迅速行动，保障合作社行为的合法性和有效性。然而，这并非绝对，因为法人保管公章也可能存在权力集中和滥用公章的风险。
   • 行政部门保管：行政部门负责合作社的日常行政管理工作，对公司事务有全面了解和统筹能力。由行政部门保管公章，可以便于统一管理和监督公章使用，确保规范性和安全性。
   • 专人保管：合作社也可以指定专门人员负责公章的保管。该人员需具备高责任心和保密意识，并经过专业培训，熟悉公章使用流程和规范。这种方式可以确保公章使用的合规性，并减少内部矛盾。

3. 公章保管的考虑因素：

   • 合作社规模：规模较小的合作社可能更倾向于由法人或行政部门保管公章，以便快速决策和执行。而规模较大的合作社则可能更倾向于设立专门的印章管理岗位或委托第三方机构保管，以确保公章使用的安全性和合规性。
   • 治理结构：合作社的治理结构也会影响公章的保管方式。如果合作社的治理结构较为集中，法人可能更倾向于保管公章。而如果治理结构较为分散，则可能需要设立更复杂的公章保管和使用机制。
   • 实际需求：合作社的实际需求也是决定公章保管方式的重要因素。例如，如果合作社经常需要对外签署重要文件，那么法人保管公章可能更为方便。而如果合作社的日常行政事务较多，那么行政部门保管公章可能更为合适。

4. 公章保管的建议：

   • 明确保管主体：无论选择哪种保管方式，合作社都应在章程或内部管理制度中明确规定公章的具体保管主体及其职责。
   • 制定使用规则：合作社应制定公章使用规则，包括公章的使用范围、审批流程、登记制度等，以确保每次使用都有据可查。
   • 设立监督机制：合作社应设立有效的监督机制，防止公章被滥用或误用。例如，可以定期对公章使用情况进行审计或检查。

总结与建议：合作社的公章保管问题并没有固定的答案，而是需要根据合作社的实际情况和相关规定来确定。合作社应综合考虑自身规模、治理结构和实际需求等因素，选择最适合的公章保管方式，并制定完善的公章管理制度。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。