旷工扣双倍工资一般是不合法的，以下从多个角度为你详细分析：

法律依据层面

1. 无法律明确授权：我国现行法律法规中，没有任何一部明确赋予用人单位可以对旷工员工扣双倍工资的权利。这意味着用人单位自行制定这样的扣款标准缺乏法律支撑。
2. 保障劳动报酬权益：根据《劳动法》等相关法律规定，工资是劳动者付出劳动后依法应获得的报酬。用人单位有义务按照劳动合同约定和国家规定，及时足额向劳动者支付劳动报酬。扣双倍工资严重侵害了劳动者获取劳动报酬的合法权益。
3. 《工资支付暂行规定》第十六条：若因劳动者的旷工行为给用人单位造成了经济损失，用人单位有权扣除部分工资作为赔偿，但扣款额度必须严格控制在劳动者当月工资的20%以内。超出此比例的扣款不符合法律规定。旷工当天，用人单位可以不支付该日的工资，但除非给用人单位造成了经济损失，否则不得额外扣减其他工资。如果劳动者因故意或重大过失给用人单位造成了经济损失，用人单位在扣除工资以弥补损失时，也必须遵循法律规定，即扣款额度不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资低于当地政府所设定的月最低工资标准，则应按照最低工资标准予以发放。

规章制度层面

如果用人单位依法制定的规章制度中明确规定了旷工的处罚措施，且该规章制度制定程序合法（如经过民主程序制定、向劳动者公示等），内容合理（不能明显畸重），那么在这种情况下，按规章制度适当扣减工资可能被认定为合法。但即便如此，扣双倍工资也通常超出了合理范畴。因为旷工主要违反的是劳动纪律，一般情况下不会直接造成等同于双倍工资的经济损失。

实际案例参考

在实际的劳动纠纷案例中，法院通常会根据上述法律规定和实际情况来判断用人单位的扣款行为是否合法。例如，曾有用人单位以员工旷工为由扣双倍工资，员工不服申请劳动仲裁，仲裁机构经审理认为用人单位的扣款行为缺乏法律依据，且扣款比例过高，最终裁决用人单位返还多扣除的工资。

劳动者权益保护建议

如果劳动者认为用人单位旷工扣双倍工资的做法侵犯了其合法权益，可以先与用人单位进行沟通协商，要求其纠正不合理的扣薪行为。协商不成的，劳动者可以向劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁来维护自身权益。

用人单位在制定内部工资支付制度时，应严格遵守相关法律法规，确保扣款行为合法合理。对于旷工行为，原则上应当扣除当日的工资，若造成经济损失，则每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。如果你还有其他关于劳动工伤（工资福利）方面的问题，可以直接向我咨询。