公司三个月不发工资，您可以通过以下途径申请赔偿及维护自身权益：

1. 与公司协商
   首先，您可以尝试与公司进行友好协商，明确表达您对工资拖欠的关切，并要求公司尽快支付拖欠的工资。在协商过程中，您可以保留好相关证据，如工资条、劳动合同、工作记录等，以备后续维权之需。如果公司愿意支付工资并达成和解，这是最为快捷和经济的解决方式。

2. 向劳动监察部门投诉
   如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门（如劳动保障监察大队）投诉。投诉时，您需要提交相关证据材料，如劳动合同、工资条、工作记录、与公司协商的记录等。劳动监察部门会依法进行调查，并责令公司限期支付拖欠的工资。如果公司逾期不支付，劳动监察部门还可以责令公司加付赔偿金，赔偿金的标准为应付金额的50%至100%。

3. 申请劳动仲裁
   除了向劳动监察部门投诉外，您还可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。在申请劳动仲裁时，您需要提交仲裁申请书、相关证据材料以及您的身份证明等。劳动争议仲裁委员会会依法进行审理，并作出裁决。如果裁决支持您的诉求，公司需要支付拖欠的工资以及可能的赔偿金。

4. 提起诉讼
   如果劳动仲裁裁决后，公司仍然不履行支付义务，或者您对劳动仲裁裁决不服，您还可以向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，您需要提交起诉状、相关证据材料以及您的身份证明等。人民法院会依法进行审理，并作出判决。如果判决支持您的诉求，公司需要支付拖欠的工资、赔偿金以及可能的诉讼费用等。

在申请赔偿的过程中，您需要注意以下几点：

• 保留好相关证据：如工资条、劳动合同、工作记录、与公司协商的记录等，这些证据将对您维权起到关键作用。
• 及时行动：不要拖延时间，一旦发现公司拖欠工资，应尽快采取行动，以免错过维权时机。
• 了解相关法律法规：熟悉《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，以便更好地维护自己的权益。

如果您在申请赔偿的过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。