针对您提出的“医药公司不开发票是否违法”的问题，我可以明确地告诉您，医药公司不开发票是违法的行为。以下是我为您详细梳理的法律依据、法律后果以及消费者权益保护的相关内容：

法律依据

1. 《中华人民共和国消费者权益保护法》第二十二条： 该条款明确规定，经营者（包括医药公司）在提供商品或服务时，必须按照国家有关规定或商业惯例向消费者出具发票等购货凭证或服务单据。当消费者索要这些凭证时，经营者必须出具，不得拒绝。

2. 《中华人民共和国发票管理办法》第十八条及第三十三条： 这些条款进一步细化了发票开具的义务和规定。销售商品、提供服务及从事其他经营活动的单位和个人，在对外发生经营业务收取款项后，应向付款方开具发票。如未按规定开具发票，例如应当开具而未开具发票，税务机关将责令改正，并可处以1万元以下的罚款；有违法所得的予以没收。

法律后果

医药公司如果不开发票，将面临以下法律后果：

• 税务机关的处罚：税务机关将责令医药公司改正其违法行为，并可能处以罚款，罚款金额最高可达1万元。同时，如果医药公司有违法所得，还将被没收。

• 信誉损害：不开发票的行为会严重损害医药公司的信誉和形象，降低消费者对其的信任度，进而影响其市场竞争力。

• 税务风险：不开发票可能涉嫌偷税漏税，增加医药公司的税务风险。在严重的情况下，还可能引发更严重的法律后果，如刑事责任。

消费者权益保护

对于消费者而言，发票是购物的重要凭证，具有以下重要作用：

• 维权证据：发票是消费者购物的直接证据，对于退换货、保修及维权等方面具有重要意义。没有发票，消费者在维权时可能会面临证据不足的困境。

• 售后保障：持有正规发票的消费者在享受售后服务时更加有保障。医药公司通常更愿意为持有发票的消费者提供优质的服务。

特殊情况处理

尽管存在某些特殊情况可能导致医药公司暂时无法立即开具发票（如系统故障、发票用完等），但这并不免除其开票义务。医药公司应向消费者说明情况，并在条件允许后及时补开发票。

举报途径

如果您作为消费者遇到医药公司拒绝开发票的情况，您有权向税务机关进行投诉举报。举报途径通常包括电话举报、在线举报或亲自前往税务机关进行面对面举报。

总结与建议：

医药公司不开发票是违法的行为，不仅会对公司造成严重的法律后果和经济损失，还会损害消费者的合法权益。因此，我建议医药公司应严格遵守相关法律法规，履行出具发票的义务。同时，消费者也应积极行使自己的权利，对于拒绝开发票的医药公司进行及时举报，共同维护健康的税收环境和市场秩序。