水果有虫能否赔偿1000元，需根据具体情况判断，包括消费者的实际损失、商家的过错程度以及相关法律法规的规定。在符合法定条件下，消费者有权要求合理的赔偿。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国食品安全法》第一百四十八条第二款，若生产或经营不符合食品安全标准的食品，消费者除要求赔偿损失外，还可主张价款十倍或损失三倍的赔偿金，且增加赔偿的金额不足一千元的，为一千元。这为消费者要求赔偿提供了明确的法律基础。同时，《中华人民共和国消费者权益保护法》也保护消费者在购买商品时享有的合法权益，对于商品质量问题，消费者有权要求赔偿。
二、赔偿金额的合理性分析
若水果中出现虫子被视为不符合食品安全标准：
- 若水果价款的十倍不足1000元，消费者要求赔偿1000元是符合法律规定的合理诉求。例如，若水果价值50元，则消费者有权要求至少500元的赔偿金，但根据法律规定，增加赔偿的金额不足一千元时，按一千元计赔，因此消费者可以要求赔偿1000元。
- 计算公式：若价款十倍<1000元，则赔偿金额=1000元；若价款十倍≥1000元，则赔偿金额=价款×10（或损失×3，取较高者）。
若商家能证明虫子的存在不影响食品安全：
- 如某些水果中天然可能存在的无害昆虫幼虫，且不会对消费者造成误导，则消费者要求赔偿1000元可能缺乏足够法律依据。但商家仍可能出于维护消费者权益和商业信誉考虑给予一定补偿。
若消费者因食用含虫子的水果遭受身体损害或其他实际损失：
- 如医疗费、护理费、交通费等，消费者可要求赔偿实际损失及三倍赔偿金。此时赔偿金额可能超过1000元，且为合理要求。
- 计算公式：赔偿金额=实际损失+损失×3（若实际损失的三倍超过价款十倍，则取实际损失的三倍；若价款十倍更高，则取价款十倍与实际损失之和中的较高者，但增加赔偿的金额不足一千元时，按一千元计赔的规则在此场景下可能被更高额度的赔偿覆盖）。
三、索赔流程与建议
保留证据：
- 消费者在发现水果有虫子后，应立即保留相关证据，包括购买凭证（发票、小票等）、带有虫子的水果实物或清晰的照片、视频等。
与商家协商：
- 首先尝试与商家进行友好协商，要求其按照上述赔偿方式进行处理。保持冷静，理性表达自己的诉求，争取达成满意的解决方案。
向相关部门投诉：
- 若协商无果，消费者可以向市场监督管理局、消费者权益保护机构（如拨打12315）或食品药品监督管理部门进行投诉。这些部门将介入调查，并根据调查结果给予相应的处罚或调解。
提起诉讼：
- 当以上途径均无法解决问题时，消费者有权向人民法院提起诉讼，通过司法程序来维护自己的合法权益。在诉讼过程中，提供充分的证据是关键，法院通常会支持消费者的合理诉求。
总结与建议：水果有虫能否赔偿1000元，需根据具体情况判断。在符合法律规定的情况下，消费者有权要求合理的赔偿。若遇到此类问题，建议消费者首先保留证据，然后与商家协商，协商无果可向相关部门投诉或提起诉讼。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。