法院对当事人对鉴定报告有异议的处理方式，主要依据《中华人民共和国民事诉讼法》《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》等相关法律法规，具体处理流程如下：

1. 当事人提出书面异议
   当事人应在法院指定的期限内（通常为收到鉴定报告后15日内）提交书面异议，明确指出鉴定报告中的程序违法、依据不足、结论错误等具体问题，并附相关证据或理由。若异议涉及专业性技术问题，可同时申请补充鉴定或重新鉴定。

2. 法院审查异议的合法性与合理性
   法院会首先审查异议是否符合法定形式要件（如期限、书面形式等），再对异议内容进行实质审查：

   • 程序性异议：如鉴定机构或鉴定人未依法回避、鉴定程序违法等，法院可能直接要求鉴定机构补正或启动重新鉴定；
     
   • 实体性异议：如鉴定方法错误、结论依据不足等，法院可能组织双方当事人质证，或要求鉴定人出庭说明。

3. 鉴定人出庭说明或补充鉴定
   根据《民事诉讼法》第82条，鉴定人应当出庭接受当事人质询，除非存在法定例外情形（如健康原因、不可抗力等）。若异议成立，法院可能要求鉴定机构补充鉴定、修正报告或出具书面说明；若异议不成立，法院会驳回申请并说明理由。

4. 重新鉴定或专家辅助人参与

   • 重新鉴定：若存在《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第40条规定的情形（如鉴定机构或鉴定人不具备资质、程序严重违法、结论明显依据不足等），法院应准许重新鉴定；
     
   • 专家辅助人：当事人可申请具有专门知识的人（专家辅助人）出庭，就鉴定报告提出专业意见，法院会结合专家意见综合判断异议是否成立。

5. 法院最终采信与裁判
   法院会综合异议内容、鉴定人说明、专家辅助人意见等，对鉴定报告的证明力作出认定。若鉴定报告被采信，将作为裁判依据；若未被采信，法院可能根据其他证据或重新鉴定结果作出判决。

实务建议：

• 当事人提出异议时，应聚焦具体问题（如鉴定方法、数据来源等），避免笼统质疑；
  
• 若需申请重新鉴定，需充分证明原鉴定存在法定瑕疵，否则法院可能不予准许；
  
• 鉴定人出庭时，当事人可准备针对性问题，以有效质询鉴定结论的合理性。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件中的异议策略。