结论概述：军婚中女方爸爸有案底，一般情况下不会直接影响男方的晋升，但具体影响需视案底性质、男方单位规定及晋升岗位的特殊要求而定。以下从不同角度进行详细分析：
案底性质与影响范围：
- 一般刑事犯罪记录：如果女方爸爸的案底是一般的刑事犯罪记录，如盗窃、诈骗等，且已经服刑完毕，这通常不会对男方的晋升产生直接影响。因为男方的晋升主要基于其个人的工作表现、能力、资历以及单位的需求和规定。
- 严重刑事犯罪或危害国家安全记录：然而，如果女方爸爸的案底涉及严重刑事犯罪，如贪污受贿、危害国家安全等，或者男方晋升的岗位对政治背景有严格要求（如涉及国家安全、机密等岗位），那么这种情况可能会对男方的晋升产生间接影响。单位在考察男方时，可能会对其家庭背景进行更为严格的审查，以评估其政治可靠性和忠诚度。
男方单位规定与晋升岗位的特殊要求：
- 单位内部规定：不同单位对于员工晋升的规定可能有所不同。有些单位可能更注重员工的个人能力和表现，而对家庭背景要求相对宽松；而有些单位则可能将家庭背景作为晋升考察的重要因素之一。因此，男方需要了解自己所在单位的具体规定，以判断女方爸爸的案底是否可能对其晋升产生影响。
- 晋升岗位的特殊要求：如果男方晋升的岗位对政治背景、家庭背景等有特殊要求，如需要政审合格等，那么女方爸爸的案底可能会成为影响男方晋升的因素之一。在这种情况下，男方需要提前了解岗位的具体要求，并做好相应的准备和应对。
法律建议与应对措施：
- 了解案底具体情况：男方可以首先了解女方爸爸案底的具体情况，包括犯罪性质、服刑情况等，以便更准确地评估其可能对晋升产生的影响。
- 咨询单位人事部门：男方可以咨询自己所在单位的人事部门或相关负责人，了解单位对于员工晋升的具体规定和要求，以及家庭背景在晋升考察中的权重和影响。
- 准备相关证明材料：如果男方认为女方爸爸的案底可能对其晋升产生不利影响，可以提前准备相关证明材料，如女方爸爸的服刑证明、无犯罪记录证明等，以证明其已经改过自新，不会对男方的政治可靠性和忠诚度产生负面影响。
特殊情况说明：在极少数情况下，如果女方爸爸的案底涉及极其严重的犯罪行为，且社会影响恶劣，可能会引发公众对男方家庭背景的关注和质疑。这种情况下，即使男方单位没有明确规定家庭背景对晋升的影响，也可能因社会舆论压力而对男方的晋升产生间接影响。然而，这种情况较为罕见，且通常需要案底性质极其恶劣、社会影响极大才会发生。
总结与建议：军婚中女方爸爸有案底，一般情况下不会直接影响男方的晋升。但男方仍需关注案底性质、单位规定及晋升岗位的特殊要求，以评估可能产生的间接影响。如有需要，男方可以咨询专业律师或单位人事部门，以获取更具体的法律建议和指导。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的解答，可以直接向我咨询。