父子之间签订的借款协议，在符合法律规定的情况下，是有效的。以下从多个角度为你详细分析：
法律有效性角度
合同成立要件：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同成立需要满足当事人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律或行政法规的强制性规定以及不违背公序良俗等条件。父子之间签订的借款协议，只要双方均具备相应的民事行为能力（如均为成年人且精神正常），且意思表示真实（即双方确实有借款和出借的意愿，并非受到欺诈、胁迫等），同时协议内容不违反法律或行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么该协议就是有效的。
身份关系不影响合同效力：虽然父子之间存在特殊的身份关系，但这并不影响他们之间签订借款协议的效力。法律并未禁止具有亲属关系的人之间签订借款合同，只要合同内容合法、双方意思表示真实，合同就具有法律效力。
实际履行角度
借款交付：借款协议的有效成立，除了需要满足上述合同成立要件外，还需要实际履行借款的交付。即出借人需要将约定的借款金额实际交付给借款人。如果只是签订了借款协议，但并未实际交付借款，那么该协议虽然成立，但并未生效。不过，在父子之间，由于存在特殊的信任关系，有时可能并不会立即进行借款的交付，而是约定一个交付时间或条件。在这种情况下，只要双方能够按照约定履行，借款协议仍然可以视为有效。
还款义务：借款人需要按照借款协议的约定，按时足额偿还借款本金和利息（如果约定了利息的话）。如果借款人未能按时还款，出借人有权要求借款人承担违约责任，包括但不限于要求借款人支付逾期利息、违约金等。在父子之间，虽然可能存在情感上的纠葛，但法律上的还款义务并不会因此而免除。
特殊情况考虑
无偿借款：如果父子之间签订的借款协议是无偿的（即不约定利息），那么该协议仍然有效。不过，在这种情况下，出借人可能无法要求借款人支付利息，但仍然可以要求借款人按时偿还借款本金。
赠与与借款的区分：有时父子之间可能会签订一些看似借款协议但实际上属于赠与的协议。例如，父亲可能出于对儿子的关爱，将一笔钱“借”给儿子，但实际上并不期望儿子偿还。在这种情况下，如果双方能够明确约定该笔款项为赠与而非借款，那么该协议就不属于借款协议，而是赠与协议。赠与协议在符合法律规定的情况下也是有效的，但赠与人在赠与财产的权利转移之前可以撤销赠与（除非是经过公证的赠与合同或者依法不得撤销的具有救灾、扶贫、助残等公益、道德义务性质的赠与合同）。
建议
明确协议内容：为了避免未来可能出现的纠纷，父子之间在签订借款协议时，应该尽可能明确协议的内容，包括借款金额、借款期限、利息（如果有的话）、还款方式等。
保留交付证据：为了证明借款已经实际交付，双方可以保留相关的交付证据，如银行转账记录、收据等。
考虑公证：如果借款金额较大或者双方对协议内容存在疑虑，可以考虑将借款协议进行公证。公证可以增强协议的法律效力，并在未来可能出现的纠纷中提供有力的证据支持。
如果你在父子借款协议方面还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。