结论：二手车换发动机本身并不违法，但前提是必须按照相关法律法规进行申请和办理手续。若未按规定进行，则属于违法行为，将面临相应的法律后果。
详细分析：
合法更换发动机的条件与流程：
- 获得合法来源的发动机：更换的发动机必须来源合法，通常应从汽车生产厂家或正规配件供应商处购买，并确保附有相应的合格证明。这是确保发动机质量，以及后续能够顺利办理变更登记的基础。
- 申请变更登记：根据《机动车登记规定》，已注册登记的机动车若更换发动机，车主必须在变更后十日内向登记地车辆管理所申请变更登记。申请时需提交的材料包括：机动车所有人的身份证明、机动车登记证书、机动车行驶证以及更换发动机的相关证明（如发动机合格证明、购车发票等）。
- 审核与验车：车辆管理所将对提交的材料进行审核，并安排车辆进行查验，以确保更换后的发动机符合相关规定。验车通过后，车管所将更新车辆档案信息，并重新核发行驶证。
- 遵守相关标准：更换的发动机应符合国家相关标准和规定，确保不影响车辆的安全性能和环保性能。这是保障道路交通安全和环境保护的重要措施。
私自更换发动机的后果：
- 面临处罚：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第十六条，任何单位或个人不得擅自改变机动车已登记的结构、构造或特征。私自更换发动机属于违法行为，公安机关交通管理部门有权扣留机动车，并要求当事人补办相应手续。拒不改正的，车主可能面临罚款、责令恢复原状等法律责任。
- 无法通过年检：私自更换发动机的车辆在年检时将无法通过，因为车辆的实际技术参数与登记信息不符。这将导致车辆无法正常上路行驶，影响车主的日常出行。
- 安全风险与保险问题：私自更换发动机可能导致车辆不符合安全标准，增加行车风险。同时，若因私自更换发动机导致车辆不符合保险条款，保险公司可能拒绝赔付，给车主带来经济损失。
建议：
- 在更换发动机前，务必了解并遵循相关的法律法规和流程，确保更换的发动机来源合法，并按照规定申请变更登记。
- 若对更换发动机的流程或相关法律法规有疑问，可以直接向我咨询，我将为你提供详细的法律指导和帮助。
- 在更换发动机后，务必及时办理变更登记手续，并确保车辆符合安全标准和环保要求，以保障自身权益和行车安全。