电动自行车非法改装主要由交通管理部门（交警部门）负责管理和处罚。以下是对此问题的详细解析：

一、管理主体与职责

电动自行车非法改装的管理主体主要是各地的交通管理部门，特别是交警部门。他们负责道路交通安全的监管，包括电动自行车的合法上路、安全性能等方面的检查。当发现电动自行车存在非法改装行为时，交警部门有权进行查处，并依据相关法律法规进行处罚。

二、常见非法改装情形及处罚

1. 加装遮阳伞、雨篷

   • 危害：这种改装会破坏车辆的稳定性，增加侧翻的风险，同时还会遮挡视线，影响交通观察。
   • 处罚：交警会责令当场拆除，并可处以20-50元罚款。

2. 改装电池

   • 危害：改装电池可能导致功率过大，引发电气故障或火灾，同时还会影响车辆的操控性能。
   • 处罚：交警会收缴违规电池，进行安全教育，并处以100-500元罚款，同时要求恢复原装电池配置。

3. 改动限速装置

   • 危害：提高速度会增加交通事故的概率，同时制动距离也会变长，难以紧急停车。
   • 处罚：交警会要求恢复限速装置至规定标准，并给予警告或处以50-200元罚款。

4. 改变车辆外观和结构

   • 危害：这种改装会影响车辆的重心和平衡性，改变风阻系数，从而威胁行驶安全。
   • 处罚：交警会责令恢复车辆原状，并处以200-500元罚款（具体金额根据情节而定）。

三、处罚依据与原则

根据《中华人民共和国道路交通安全法》第十六条的规定，任何单位或个人不得拼装机动车或擅自改变机动车已登记的结构、构造或特征。虽然电动自行车在部分属性上与机动车有所区别，但在非法改装管理上，各地多参照此原则进行处理，并结合当地电动车管理条例进行规范。

四、其他法律后果

1. 保险拒赔：如果非法改装电动自行车发生交通事故，保险公司可能因车辆不符合安全标准而拒绝理赔。
2. 无法通过年检：在需要年检的地区，非法改装电动自行车将无法通过年检，影响车辆合法上路。
3. 民事与刑事责任：若非法改装导致交通事故，车主可能需承担民事赔偿责任，甚至面临刑事责任的追究。

五、建议与提醒

为避免不必要的法律风险和损失，我建议车主在改装电动自行车前应充分了解相关法律法规，并确保改装行为符合规定。同时，应定期对车辆进行检查和维护，确保车辆的安全性能得到保障。如果车主对电动自行车的改装有任何疑问或需要法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。