案件三年后能否再立案，这主要取决于案件的性质以及是否超过了法定的诉讼时效期间。以下从几个不同角度进行分析：
刑事案件：
- 对于刑事案件，特别是涉及犯罪行为的，一般不存在“三年后不能立案”的绝对说法。刑事案件的立案主要依据的是犯罪行为的发生和证据的收集情况，而非单纯的时间因素。只要犯罪行为被发现，且有足够的证据支持立案，即使已经过去多年，仍然可以立案侦查。当然，也存在一些特殊情况，如犯罪已过追诉时效期限的，不再追诉，但这需要根据具体的犯罪类型和法定追诉时效来判断。
民事案件：
- 对于民事案件，特别是涉及合同纠纷、侵权纠纷等，诉讼时效是一个重要的考虑因素。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，一般的民事诉讼时效期间为三年。这意味着，如果权利人在知道或应当知道其权利受到损害之日起三年内没有提起诉讼，那么其可能丧失胜诉权。但是，这并不意味着案件不能立案，只是如果对方提出诉讼时效抗辩，法院可能会驳回原告的诉讼请求。
- 此外，也存在一些特殊情况，如诉讼时效中止、中断等，这些情况下诉讼时效可能会重新计算或延长。因此，即使已经超过三年，如果存在诉讼时效中止、中断的情形，仍然有可能立案并获得法院的支持。
行政案件：
- 对于行政案件，如行政处罚、行政许可等引发的纠纷，一般也有相应的起诉期限规定。如果超过了法定的起诉期限，法院可能会不予受理。但是，与民事案件类似，如果存在一些特殊情况，如不可抗力或其他正当理由导致未能及时起诉，法院也可能会根据具体情况进行裁量。
法律建议：
- 如果您面临的是刑事案件，且犯罪行为刚刚被发现或证据刚刚收集完毕，那么无论已经过去多久，都可以考虑向公安机关报案并要求立案侦查。
- 如果您面临的是民事案件，且已经超过三年诉讼时效期间，建议您先咨询专业律师，评估是否存在诉讼时效中止、中断的情形，以及是否有其他途径可以维护您的权益。
- 如果您面临的是行政案件，且已经超过法定的起诉期限，同样建议您咨询专业律师，了解是否存在特殊情况可以导致起诉期限的延长或重新计算。
可能后果：
- 如果案件已经超过法定诉讼时效期间或起诉期限，且不存在中止、中断等情形，那么您可能会面临败诉的风险或法院不予受理的情况。
- 但是，即使案件已经超过一定时间，如果仍然有足够的证据支持您的主张，且对方没有提出有效的抗辩，您仍然有可能获得法院的支持。
总之，案件三年后能否再立案并不是一个简单的问题，它取决于案件的性质、是否超过法定诉讼时效期间或起诉期限以及是否存在特殊情况等因素。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。