合同写着一式一份，执甲方一份，但存在两份且乙方持有一份的情况下，乙方持有的那份合同通常是有效的。以下是对这一结论的详细解释：

1. 合同份数与效力：

   • 合同上写明“一式一份，执甲方一份”通常意味着合同原本计划只制作一份，并由甲方保管。
   • 然而，如果实际上制作了两份，且乙方也持有一份，那么这份合同在法律上并不因为份数的增加而失效。
   • 合同的效力主要取决于合同内容是否合法、双方是否真实意愿表达、是否违反法律法规等，而不是合同的份数。

2. 乙方持有合同的效力：

   • 乙方持有的合同，如果内容完整、真实，且没有违反法律法规，那么这份合同对乙方来说是有法律效力的。
   • 乙方可以依据这份合同来维护自己的合法权益，包括要求甲方履行合同义务等。

3. 可能的情况分析：

   • 如果甲方主张合同只有一份且由甲方保管，而乙方却持有一份，这可能涉及合同的真实性或甲方的管理问题。
   • 在这种情况下，双方可能需要通过法律途径来确认合同的效力，比如通过法院诉讼或仲裁等方式。

4. 法律建议：

   • 如果乙方持有合同并希望确认其效力，建议咨询专业律师（即我），以便根据具体情况提供更具针对性的法律建议。
   • 在处理合同纠纷时，保留好所有与合同相关的证据，包括合同文本、双方沟通记录等，以便在需要时提供证明。

综上所述，即使合同上写明“一式一份，执甲方一份”，但如果实际上存在两份且乙方持有一份，那么乙方持有的那份合同通常是有效的。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。