营运客车超员50%以上的，将面临行政处罚和可能的刑事责任追究，具体处罚措施如下：

1. 行政处罚：

   • 罚款：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条的规定，公路客运车辆载客超过额定乘员50%的，处2000元罚款。
   • 扣分：依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶公路客运汽车载人超过核定人数50%以上的，一次记12分。
   • 扣车与转运：公安机关交通管理部门会扣留机动车至违法状态消除，并要求驾驶人安排转运超员乘客，相关转运费用由驾驶人承担。

2. 刑事责任：

   • 危险驾驶罪：若超员行为构成“严重超过额定乘员载客”，根据《中华人民共和国刑法》第一百三十三条之一的规定，驾驶人可能被以危险驾驶罪追究刑事责任，处拘役并处罚金。
   • 立案标准：根据相关司法解释，驾驶公路客运车辆载客超过额定乘员50%以上，属于“严重超员”情形，公安机关应立案侦查。

3. 其他后果：

   • 从业资格限制：若驾驶人属于专业运输单位员工，单位可能因未履行安全管理职责被处罚，驾驶人还可能面临行业禁入等限制。
   • 保险理赔影响：超员导致的交通事故，保险公司可能依据免责条款拒绝赔偿，增加驾驶人或车主的经济负担。

建议：营运客车驾驶人应严格遵守载客规定，避免超员行为。若已发生超员，应立即消除违法状态并配合调查。如有进一步疑问，可直接向我咨询相关法律问题。