违背公司章程的股东会决议，其效力需根据具体情况判断，可能无效、可撤销或有效（存在轻微瑕疵且不影响实质）。以下是对这一问题的详细分析：
一、决议无效的情形
内容违法：
- 若股东会决议的内容直接违反法律、行政法规的强制性规定（特别是效力性强制性规定），则该决议无效。例如，决议决定从事走私、贩毒等非法经营活动，或决议内容损害债权人利益、非法分配利润等，均因违反法律强制性规定而无效。
- 法律依据：根据《中华人民共和国公司法》第二十五条，公司股东会、董事会的决议内容违反法律、行政法规的无效。
严重违反公司章程且损害股东权益：
- 若决议内容严重违反公司章程，且损害了股东的合法权益，如剥夺股东表决权、非法转移公司资产等，该决议也可能被认定为无效。
二、决议可撤销的情形
程序违反公司章程：
- 若股东会会议的召集程序、表决方式违反法律、行政法规或公司章程，或者决议内容违反公司章程，股东可在决议作出之日起六十日内请求人民法院撤销。但召集程序或者表决方式仅有轻微瑕疵，对决议未产生实质影响的除外。
- 具体情形：包括未按规定提前通知股东即召开会议并作出决议、表决方式不符合章程规定的比例要求、会议记录不完整导致无法追溯决策过程等。
- 法律依据：根据《中华人民共和国公司法》第二十六条，公司股东会、董事会的会议召集程序、表决方式违反法律、行政法规或者公司章程，或者决议内容违反公司章程的，股东自决议作出之日起六十日内，可以请求人民法院撤销。但是，股东会、董事会的会议召集程序或者表决方式仅有轻微瑕疵，对决议未产生实质影响的除外。未被通知参加股东会会议的股东自知道或者应当知道股东会决议作出之日起六十日内，可以请求人民法院撤销；自决议作出之日起一年内没有行使撤销权的，撤销权消灭。
未通知股东参会：
- 若未被通知参加股东会会议的股东自知道或者应当知道股东会决议作出之日起六十日内，可以请求人民法院撤销该决议；自决议作出之日起一年内没有行使撤销权的，撤销权消灭。
三、决议有效的情形（存在轻微瑕疵但不影响效力）
- 轻微瑕疵：
- 尽管股东会决议存在某些轻微违反公司章程的瑕疵，但若这些瑕疵不影响决议的实质内容和结果，且不违反法律、行政法规的强制性规定，也未损害股东合法权益，该决议仍可能被认定为有效。例如，会议记录缺少记录人签字，但决议内容合法且表决程序合规。
- 司法实践：法院会根据具体案件事实和证据，综合考虑各种因素判断决议效力。若瑕疵对决议无实质影响，可能认定决议有效。
四、综合考量与法律建议
全面考量：
- 在确定决议效力时，需考虑决议与章程的冲突程度、是否有善意第三方参与、相关方是否表达过疑虑等因素。例如，若决议内容虽违反公司章程，但已得到全体股东的事后追认，或已实际履行且未造成损害，法院可能倾向于维持决议效力。
法律诉讼及后续处理：
- 涉及法律诉讼时，法院将依据证据材料、法律条款审视决议有效性。决议被人民法院宣告无效、撤销或者确认不成立的，公司应当向公司登记机关申请撤销根据该决议已办理的登记。股东会、董事会决议被人民法院宣告无效、撤销或者确认不成立的，公司根据该决议与善意相对人形成的民事法律关系不受影响。
建议与总结：
- 严格遵守：公司在制定和执行决议时，应严格遵守公司章程和相关法律法规，确保决议的合法性和有效性。
- 灵活处理：面对违反公司章程的决议，应根据具体情况和法律条款灵活选择处理方式，如请求法院宣告无效或申请撤销。
- 风险防范：建议公司定期审查公司章程与最新法律法规的契合度，采用电子投票等方式确保表决程序透明可追溯，并对重大事项聘请专业律师进行合规审查。
总结来说，违背公司章程的股东会决议，其效力并非一概而论，而是需根据具体内容、程序及法律后果进行综合判断和处理。如有具体案件或疑问，欢迎直接向我咨询，我将结合实际情况为你提供更详细的法律建议。