您好，关于您提出的“一个户口本两个宅基地是否合法”的问题，这确实是一个涉及农村宅基地管理的重要议题。下面我将结合相关法律法规和实际情况，为您详细解答。
首先，我们需要明确的是，根据我国土地管理法的规定，农村村民一户通常只能拥有一处宅基地，这是为了保障土地资源的合理利用和农村社会的稳定发展。然而，在实际操作中，也存在一些特殊情况，使得一户可能拥有两处或更多宅基地，这些情况是否合法，需要具体分析。
合法的一户两宅情况：
因分户而存在的一户多宅：如果家庭成员较多，原有住宅无法满足居住需求，且未进行分户但已重新选址建房，这种情况下，如果后续进行了分户处理，那么多出来的宅基地是可以进行确权处理的，即视为合法。
因户口回迁造成的一户多宅：部分人因满足条件将户口迁回农村，但因管理部门疏忽造成一户多宅，若这种情况有合理依据，也是合法的。
因继承造成的一户多宅：虽然宅基地本身不能继承，但宅基地上的房屋可以继承。因此，如果因继承房屋而造成的一户多宅，也是合法的。不过，继承人对房屋只有使用权，没有修缮权，房屋倒塌后不能再重建。
宅基地总面积符合当地规定的一户多宅：部分地区因地理条件受限，初次建房面积狭小，不满足居住需求，重新申请宅基地建房后，如果两次或多次建造的房屋总面积未超过当地政策标准，那么也是合法的。
非法的一户两宅情况及处理：
如果一户两宅不符合上述合法情况，那么通常被视为非法。对于非法的一户多宅，处理方式有多种，包括但不限于：
有偿使用：部分地区试行农村宅基地有偿使用政策，如果宅基地面积超过当地标准，需要缴纳一定费用才能继续居住使用。
转让：可以将多出来的宅基地转让给同村集体组织的成员，但转让后的双方都需要满足一户一宅的原则。
自愿有偿退出：如果农户在城市有房产且户口已迁出，原有农村宅基地可以根据农户意愿进行处理，如自愿有偿退出。
强制收回：在极少数情况下，如建新未拆旧、强制占用宅基地特别是耕地建房、骗取宅基地建房等，村集体组织可以实施强制收回。
总结与建议：
综上所述，一个户口本两个宅基地是否合法，取决于具体情况。如果符合上述合法情况之一，那么就是合法的；否则，可能被视为非法，并面临相应的处理。因此，我建议您先了解自己宅基地的具体情况，包括建房时间、原因、面积等，然后咨询当地国土资源部门或村委会，以获取更准确的法律意见和处理建议。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。