结论：你父亲闯红灯，不会扣你的分数，扣分是扣在实际驾驶员（即你父亲）的驾驶证上。

详细分析：

1. 扣分原则：

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，交通违法行为的处罚对象是实际驾驶人，而非车主。这意味着，无论车辆是谁的，只要闯红灯等违法行为是由某个驾驶员实施的，那么扣分和处罚就会针对该驾驶员。
   • 在你描述的情况中，你父亲是实际驾驶人，因此他闯红灯的违法行为将由他本人承担责任，扣分也会扣在他的驾驶证上。

2. 处理流程：

   • 如果闯红灯的行为被电子眼抓拍，电子眼会记录车辆信息。你父亲在收到违章通知后，需要携带自己的驾驶证、身份证以及车辆行驶证，前往当地交警大队或相关违章处理窗口接受处罚。此时，违章扣分就会计入你父亲的驾驶证名下。
   • 如果闯红灯的行为是被交警现场查处的，交警会直接认定实际驾驶人（即你父亲），并开具处罚决定书。处罚决定书中会明确针对你父亲进行处罚和扣分，扣分直接扣在你父亲的驾驶证上。

3. 特殊情况说明：

   • 在某些特殊情况下，如你父亲指使或强迫你无证驾驶导致违章，那么你父亲可能因监管不力或指使违法而承担连带责任。但这种情况与单纯的闯红灯行为不同，且需要具体的证据来支持。
   • 在你描述的情况中，并没有提及任何特殊情况，因此我们只需按照一般的扣分原则和处理流程来理解。

法律建议：

• 作为驾驶员，应当严格遵守交通法规，确保安全驾驶，避免违章行为的发生。这不仅可以保护自己的驾驶证不受影响，还可以维护道路交通秩序和安全。
• 如果你父亲对违章处罚有异议或疑问，可以及时向交警部门咨询或申请复议。在处理违章时，务必携带好相关证件和资料，以便顺利完成处理流程。

可能法律后果：

• 如果你父亲未按时处理违章或缴纳罚款，可能会面临更严重的处罚，如滞纳金、强制执行等。因此，建议及时处理违章并缴纳罚款，以避免不必要的麻烦和损失。

希望以上分析能对你有所帮助。如果你还有其他法律问题或疑问，可以直接向我咨询。