开亲戚的车闯了红灯，扣分是扣在实际驾驶员（即你）的驾驶证上，而非车主（即你亲戚）的驾驶证。

详细分析如下：

在交通违法处理中，针对闯红灯这一行为，扣分和处罚是针对实际驾驶人的，而不是车主。这一原则基于《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，明确指出机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规时，处罚应直接针对实际的驾驶员。

具体处理方式根据违法行为的记录方式有所不同：

1. 电子眼抓拍：

   • 当闯红灯等违法行为被电子眼抓拍后，电子眼主要记录的是车辆信息。
   • 车主在收到违章通知后，可以说明当时实际驾驶车辆的是你。
   • 你需要携带自己的驾驶证、身份证以及车辆行驶证，前往当地交警大队或相关违章处理窗口接受处罚。此时，违章扣分就会计入你的驾驶证名下。

2. 交警现场执法：

   • 如果闯红灯的行为是被交警现场查处的，交警会直接认定实际驾驶人，并开具处罚决定书。
   • 处罚决定书中会明确针对你进行处罚和扣分，扣分直接扣在你的驾驶证上。

此外，根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》的相关规定，闯红灯的违法行为一次记六分，并处罚款200元。你作为驾驶员，在收到违章通知后，应及时到交警部门处理违章，缴纳罚款，并接受相应的扣分处理。

综上所述，无论闯红灯的行为是通过电子眼抓拍还是交警现场查处，扣分都是扣在实际驾驶员的驾驶证上。因此，你应当严格遵守交通法规，确保安全驾驶，避免违章行为的发生，以免对自己的驾驶证造成不良影响。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。