关于公司车辆运输途中货物损坏发生赔偿引起诉讼的法院管辖权问题，并不一定在运输公司驻地，具体取决于多种因素。以下从不同角度为您详细分析：

1. 合同约定优先：

   • 如果运输合同中明确约定了发生争议时的管辖法院，那么应当遵循合同中的约定。这是基于《中华人民共和国民事诉讼法》中关于协议管辖的规定，即合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。
   • 举例：若运输合同中约定“因本合同产生的任何争议，均应提交至甲方（即托运方）所在地人民法院管辖”，那么一旦发生货物损坏赔偿诉讼，就应由托运方所在地法院管辖，而非运输公司驻地法院。

2. 无约定时的法定管辖：

   • 如果运输合同中没有约定管辖法院，那么根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，因铁路、公路、水上、航空运输和联合运输合同纠纷提起的诉讼，由运输始发地、目的地或者被告住所地人民法院管辖。
   • 分析：在这种情况下，运输公司驻地（即被告住所地）只是可能的管辖法院之一，并非绝对。如果货物损坏发生在运输途中，且运输始发地或目的地与运输公司驻地不同，那么原告（通常是托运方或收货方）也可以选择向运输始发地或目的地法院提起诉讼。

3. 特殊情况下的管辖：

   • 如果货物损坏是由于运输公司的故意或重大过失造成的，且这种行为可能构成犯罪（如盗窃、抢劫等），那么相关刑事案件的管辖将遵循刑事诉讼法的规定，与民事赔偿诉讼的管辖可能不同。
   • 另外，如果货物损坏涉及多个运输段或多个运输公司，且各运输段或运输公司之间的责任划分不明确，那么可能需要通过更复杂的法律程序来确定管辖法院和责任归属。

法律建议：

• 在签订运输合同时，建议明确约定发生争议时的管辖法院，以避免后续诉讼中的管辖权争议。
• 如果发生货物损坏赔偿诉讼，且对管辖法院有疑问，建议及时咨询专业律师，以便根据具体情况确定合适的诉讼策略。

可能后果：

• 如果错误地选择了管辖法院，可能会导致案件被移送至有管辖权的法院审理，从而增加诉讼成本和时间成本。
• 在极端情况下，如果因管辖权问题导致诉讼无法顺利进行，可能会影响当事人的合法权益得到及时保障。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。