合同尾款支付完毕后，合同通常视为履行完毕，但需根据具体情况采取以下措施确保权益：

1. 确认合同履行状态
   首先需核查合同条款中关于“尾款支付”的约定。若合同明确约定“尾款支付后合同即终止”，则双方权利义务已履行完毕；若合同未明确约定，需结合交易习惯判断（如是否需签署终止协议、交付最终成果等）。
   示例：若合同约定“甲方支付尾款后，乙方需在3日内交付最终验收报告”，则尾款支付后乙方仍需履行交付义务，否则可能构成违约。

2. 保留关键证据
   即使合同已履行完毕，仍需保留以下材料以备争议：

   • 支付凭证（银行转账记录、发票等）；
     
   • 合同原件及补充协议；
     
   • 双方沟通记录（邮件、微信等）；
     
   • 验收文件（如签收单、验收报告）。
     法律依据：根据《民法典》第469条，书面合同是证明双方权利义务的主要证据，保留证据可避免未来纠纷。

3. 处理潜在风险

   • 质量瑕疵：若合同履行后发现质量问题（如货物不符合约定标准），需在质保期内主张权利。根据《民法典》第621条，买受人需在发现或应当发现质量问题的合理期限内通知出卖人，否则可能丧失主张权利的机会。
     
   • 后续义务：部分合同可能约定保密、竞业限制等附随义务，即使尾款支付完毕，仍需履行相关义务，否则可能承担违约责任。

4. 特殊情形处理

   • 合同解除：若尾款支付后发现对方存在根本违约（如欺诈、无法履行主要义务），可依据《民法典》第563条主张解除合同，并要求返还已支付款项及赔偿损失。
     
   • 税务合规：确保尾款支付与发票开具一致，避免税务风险。根据《税收征收管理法》第63条，虚开发票或未按规定开具发票可能面临罚款。

建议行动步骤：

1. 立即整理合同及相关凭证，确认双方义务是否全部履行；
   
2. 若发现对方未履行义务（如未交付成果、质量问题），书面催告并留存证据；
   
3. 如有争议，可依据合同约定或法律规定主张权利，必要时通过诉讼或仲裁解决。
   

如有具体合同条款或纠纷细节，可进一步向我说明，我会结合实际情况提供针对性建议。