签了就业协议但辞职了，档案是否会放入原单位档案中，主要取决于离职后的档案处理方式，而非单纯取决于是否签订了就业协议或辞职这一行为本身。 以下是根据不同情况对档案处理方式的详细分析：

1. 试用期内离职：

   • 在试用期内离职，由于劳动关系相对灵活，你可以与原单位沟通，请求协助将档案转至新接收单位（如有）或合法档案托管机构。
   • 若单位有明确的档案管理规定和离职流程，需按要求填写表格、提交申请等，完成档案转出手续。

2. 正式入职后离职：

   • 有新接收单位：
     • 如果新单位具备档案管理权限（如国有企业、事业单位、政府机关等），由新单位开具调档函，原单位按规定转递档案。
     • 如果新单位不具备档案管理权限，新单位通常委托人才市场、人才交流中心等第三方机构托管档案。此时，需先确认托管机构，由其出具调档函，再通过原单位办理档案转递。
   • 暂无新接收单位：
     • 可以将档案转回户籍所在地的人才交流中心或人力资源和社会保障局等相关机构。需向户籍所在地档案管理部门提出托管申请，提供相关材料（如身份证、毕业证、离职证明等）。
     • 部分情况下，也可以与原单位协商，了解是否提供档案暂存服务及相关费用和后续手续。

3. 离职后暂未就业或自主创业：

   • 可以将档案转回户口所在地社保所，办理失业登记，领取失业金或享受国家相关优惠政策。
   • 也可以将档案转至职业介绍中心，自行缴纳社会保险，待交够规定年限后享受养老保险待遇。

4. 档案在自己手中的特殊情况：

   • 如果档案密封完好，可以携带就业报到证、个人身份证等资料到户籍所在地或工作单位所在地的人才中心进行托管。
   • 如果封条拆封或破损，需要找原毕业学校或原单位档案负责人重新审核密封，再以公对公的方式存入人才中心。

法律依据与注意事项：

• 根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十条，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。这确保了档案转移的合法性和及时性。
• 在办理档案转移过程中，务必保留好调档函、档案转递通知单、离职证明等凭证，以备日后查询和使用。
• 如遇困难或无法自行处理档案转移问题，可以直接向我咨询，我会提供专业的法律协助。

综上所述，签了就业协议但辞职后，档案的处理方式取决于你的个人实际情况和新工作单位的性质。务必遵循相关法律法规，确保档案得到妥善保管和及时转移，以避免不必要的麻烦和损失。