结论：法院冻结公司股权通常不直接涉及公司土地，且冻结股权本身不影响公司登记设立（但特定情形下可能间接影响）。以下从法律关系、冻结范围、登记设立条件三个角度展开分析：

一、股权冻结与土地权属无直接关联

1. 法律关系独立性
   根据《公司法》第三条，公司是企业法人，拥有独立的法人财产权。股权是股东对公司的投资权益，属于股东个人财产范畴；而土地使用权通常登记在公司名下，属于公司法人财产。二者在法律主体和权属上相互独立，法院冻结股权仅限制股东处分权（如转让、质押），不直接涉及公司土地的权属或处置。

2. 例外情形：土地为股权担保物时
   若股东以公司土地为自身债务提供抵押担保，且法院在执行中认定该土地与股权存在关联（如股权价值依赖土地资产），可能依据《民事诉讼法》第二百四十四条对土地采取查封、拍卖等措施。但此情形下，冻结对象仍是土地而非股权本身，需通过另案执行程序实现。

二、股权冻结不影响公司登记设立的“形式合法性”

1. 登记设立的核心条件
   根据《公司登记管理条例》第九条，设立公司需满足股东符合法定人数、有符合章程规定的出资、有公司名称及住所等条件。股权冻结仅限制股东权利，不改变公司作为独立法人的主体资格，亦不否定股东已履行的出资义务（除非冻结导致出资无法到位）。因此，冻结股权本身不构成公司登记设立的实质性障碍。

2. 潜在间接影响：实务操作层面

   • 工商变更登记受限：若冻结期间股东需办理股权变更登记（如转让、增资），工商部门可能依据《公司登记管理条例》第三十四条拒绝受理，导致公司股权结构无法及时更新。
     
   • 融资或合作受阻：部分合作方或金融机构可能因股权冻结质疑公司稳定性，要求提供额外担保或终止合作，间接影响公司运营资金和设立后的业务开展。

三、实务建议：如何应对股权冻结与登记设立的冲突

1. 若公司拟设立且股东股权被冻结

   • 提前沟通工商部门：向登记机关说明冻结不涉及公司财产，提交股东出资证明、公司章程等材料，争取正常办理设立登记。
     
   • 调整股权结构：通过股权代持、增资扩股等方式引入未被冻结的新股东，降低冻结对设立的影响。
     

2. 若公司已设立且股东股权被冻结

   • 区分股东权利与公司权利：在合同、公告中明确公司财产独立于股东财产，避免第三方误认为冻结涉及公司资产。
     
   • 申请解除冻结或置换担保：若冻结错误或已履行债务，可依据《民事诉讼法》第二百三十二条向法院申请解除冻结；或提供其他等值财产置换被冻结股权，恢复股东权利。

总结：股权冻结与土地权属、公司登记设立在法律上分属不同范畴，但实务中需关注冻结对股权变动、融资合作等环节的间接影响。如有具体案件或操作细节需进一步分析，可直接向我咨询。