结论：公司以你破坏合作为由拒绝支付款项，这一行为是否合法需结合具体情况判断。以下从不同角度为你分析并提供建议。
一、公司主张的“破坏合作”是否成立
合同条款审查：
- 首先，需仔细审查你与公司签订的劳动合同或相关协议中，是否有关于“不得破坏公司合作”的具体条款，以及这些条款是否明确规定了相应的违约责任和处罚措施。
- 如果合同中有明确约定，且你的行为确实违反了这些条款，那么公司可能有一定的法律依据来拒绝支付款项或要求你承担违约责任。
事实证据分析：
- 公司需要提供充分的证据来证明你“破坏了公司合作”。这可能包括但不限于：你与其他合作方的沟通记录、合作方因你的行为而取消合作的证明、公司因此遭受的损失计算等。
- 如果没有确凿的证据支持公司的主张，那么其拒绝支付款项的行为可能缺乏合法依据。
二、公司拒绝支付款项的合法性
工资支付规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
- 如果公司无正当理由拒绝支付你应得的款项，这可能构成违法行为，你有权要求公司支付并可能寻求法律救济。
违约责任与赔偿：
- 即使公司能够证明你“破坏了公司合作”，其拒绝支付全部款项的行为也可能不完全合法。公司可能只能根据合同约定或法律规定要求你承担相应的违约责任或赔偿损失，而不能直接拒绝支付你应得的劳动报酬。
三、你的应对策略
与公司沟通协商：
- 首先，尝试与公司进行友好沟通，了解公司拒绝支付款项的具体原因和依据。
- 如果公司提出的是合理的违约责任或赔偿要求，你可以考虑与公司协商解决方案，如分期支付、减免部分款项等。
收集证据并准备维权：
- 如果公司无法提供充分的证据支持其主张，或者其拒绝支付款项的行为明显违法，你可以开始收集相关证据（如劳动合同、工资条、沟通记录等）以备维权之需。
- 你可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司支付应得的款项并可能要求公司承担违法行为的法律责任。
寻求法律援助：
- 如果你在处理此事过程中遇到困难或不确定如何操作，可以寻求专业律师的法律援助。作为专注于公司事务和婚姻家庭领域的律师，我可以为你提供具体的法律建议和帮助。
建议：在处理此类纠纷时，保持冷静和理性至关重要。首先尝试与公司沟通协商解决问题；如果无法达成一致意见，再考虑通过法律途径维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。