结论：如果公司要求写付清证明但实际上未支付，在起诉时能否胜诉取决于多种因素，包括证据的充分性、证明的真实性以及是否存在欺诈或误解等情形。以下从不同角度进行分析：

一、证据的充分性

1. 书面证据：若您能提供书面证据，如合同、付款记录、银行转账凭证等，证明公司实际上并未支付款项，这将对您在诉讼中主张权利非常有利。书面证据具有直接性和客观性，能够清晰地反映事实真相。

2. 证人证言：如果有目击者或了解情况的人愿意出庭作证，证明公司未支付款项，这也可以作为辅助证据。但证人证言的证明力相对较弱，需要结合其他证据一起使用。

3. 对方承认：如果公司在诉讼过程中承认未支付款项，或者您能通过录音、聊天记录等方式获取到公司承认未支付的证据，这将大大增强您的胜诉可能性。

二、证明的真实性

1. 付清证明的效力：付清证明本身是一种书面证据，但如果其内容与事实不符，即公司实际上并未支付款项，那么该证明的真实性将受到质疑。在诉讼中，法院会对证据的真实性进行审查，如果发现证明是伪造的或存在欺诈行为，将不会采纳该证据。

2. 证明的来源：如果付清证明是由公司单方面出具，且没有您的签字确认或其他相关证据支持，那么该证明的证明力将相对较弱。在诉讼中，您需要提供相反的证据来反驳该证明的真实性。

三、欺诈或误解的情形

1. 欺诈行为：如果公司故意要求您出具付清证明，但实际上并未支付款项，且存在欺诈的故意和行为，那么您可以在诉讼中主张公司构成欺诈，要求法院撤销该证明并判决公司支付款项。

2. 误解情形：如果双方在出具付清证明时存在误解，即您误以为公司已经支付了款项而出具了证明，但实际上公司并未支付，那么您可以在诉讼中主张撤销该证明，并要求公司支付款项。但这种情况下，您需要提供充分的证据来证明误解的存在。

四、法律建议

1. 收集证据：在诉讼前，您应尽可能收集所有与案件相关的证据，包括书面证据、证人证言、对方承认等，以证明公司实际上并未支付款项。

2. 咨询律师：由于诉讼涉及复杂的法律程序和证据规则，建议您在诉讼前咨询专业律师，了解您的权利和义务，以及诉讼的可能结果和风险。

3. 提起诉讼：在收集到充分证据并咨询律师后，如果您认为胜诉的可能性较大，可以向法院提起诉讼，要求公司支付款项并承担诉讼费用。

最后，每个案件的具体情况都有所不同，因此以上分析仅供参考。如果您面临此类问题，建议直接向我咨询，以便我能根据您的具体情况提供更详细的法律建议。