在小区内建立垃圾中转站是否合法，这并非一个简单的“是”或“否”的问题，而是需要综合考虑多个方面的法律规定和程序要求。以下是对这一问题的详细解答：
一、规划与审批层面
城乡规划法：垃圾中转站的建设必须严格遵循城市总体规划和详细规划。这意味着，在建设之前，必须向城乡规划主管部门申请并获得建设工程规划许可证。若未取得此许可，建设行为将被视为违法，可能面临限期拆除、罚款等处罚。
环境影响评价：根据《建设项目环境保护管理条例》及《环境影响评价法》，垃圾中转站作为可能对环境产生显著影响的项目，必须进行环境影响评价。这包括编制环境影响报告书、报告表或登记表，并经过环保部门的审批。评价内容涵盖空气、水质、土壤等环境要素，并需制定相应的环境保护措施。
二、土地使用权与建筑许可层面
土地使用权：建立垃圾中转站必须确保已合法取得土地使用权，这可能涉及土地出让、租赁或划拨等方式，具体需依据当地政府政策和规定执行。
建筑许可：在开始建设前，还需向建设行政主管部门申请建筑许可证，并严格按照批准的图纸和规范进行施工。施工完成后，还需通过相关部门的验收，以确保建筑质量和安全符合国家标准。
三、环保与运营管理层面
环保法规遵守：垃圾中转站的建设和运营必须严格遵守《环境保护法》、《大气污染防治法》及《噪声污染防治法》等相关法规。这要求采取有效措施防治废气、废水、废渣、噪声等污染，如安装除臭设备、采取覆盖和密闭运输措施减少扬尘和异味排放，选用低噪声设备并设置隔音屏障等。
城市生活垃圾管理办法：作为城市生活垃圾收集、转运的重要设施，垃圾中转站的建设和运营还需符合《城市生活垃圾管理办法》的相关技术标准和规范。运营单位需建立健全垃圾收集、运输管理制度，确保垃圾及时、安全地转运至处理场所。
四、物权与相邻关系层面
建筑物区分所有权：若垃圾中转站建设涉及占用小区公共区域，需经过业主共同决定。具体来说，需满足专有部分面积占比三分之二以上且人数占比三分之二以上的业主参与表决，并经参与表决专有部分面积四分之三以上且参与表决人数四分之三以上的业主同意。
相邻关系：垃圾中转站的建设和运营不得损害相邻业主的合法权益，如通风、采光、通行等权利。若造成妨碍或损失，应承担排除妨碍、赔偿损失等民事责任。
五、公众参与与信息公开层面
在垃圾中转站的建设和运营过程中，应充分尊重公众的知情权、参与权和监督权。政府或建设单位应公开相关信息，听取公众意见，并及时回应公众关切，以确保项目的透明度和公信力。
六、特殊规定与政策层面
某些地区或城市可能针对垃圾中转站有特殊规定或政策。因此，在具体操作时，还需参考当地的相关法规和政策文件，以确保项目的全面合规。
总结：小区内建立垃圾中转站是一个复杂且涉及多个法律领域的过程。建设单位和运营单位必须严格遵守相关法律法规和程序要求，确保项目的合法性和合规性。同时，还需充分考虑对环境和居民权益的影响，采取有效措施最小化负面影响。若您所在的小区有建立垃圾中转站的计划，建议您及时咨询当地相关部门或专业律师，以获取更具体、更准确的法律指导。