结论前置：在农村耕地上建房，一般情况下是不合法的，因为这违反了我国严格的土地用途管制和耕地保护制度。但在特定条件下，经过合法审批程序将耕地转为建设用地后，建房行为可以变得合法。
一、不合法的情形及依据
土地用途管制与耕地保护原则：
- 我国实行严格的土地用途管制制度，耕地作为农业生产的基础，其用途受到法律的严格保护。根据《土地管理法》的相关规定，禁止占用耕地进行非农业建设，如建窑、建坟、建房等。未经批准擅自改变耕地用途，是违法的行为。
法律后果：
- 如果非法占用耕地建房，县级以上人民政府自然资源主管部门有权责令退还非法占用的土地，并限期拆除在非法占用的土地上新建的房屋。此外，违法者还可能面临罚款等行政处罚，且拆除费用通常由违法者承担。
对土地和资源的影响：
- 擅自在耕地上建房会破坏耕地的原有功能，导致土壤质量下降、生态环境破坏以及粮食生产能力的降低。这不仅影响农业可持续发展，还可能对国家的粮食安全构成威胁。
二、特殊合法情况及条件
国家重点建设项目：
- 在特定情况下，如因国家能源、交通、水利、军事设施等重点建设项目选址确实难以避让永久基本农田，涉及农用地转用或者土地征收的，必须经国务院批准后方可实施。这种情况下，耕地可以依法转为建设用地，用于重点项目建设。
合法的审批程序：
- 农村村民在符合宅基地申请条件的前提下，可以通过一系列法定程序将耕地依法转为建设用地后再建房。这包括经过本集体经济组织同意、乡（镇）人民政府审核、县级人民政府批准等步骤，并办理农用地转用审批手续。只有经过这些合法程序，耕地才能被转为建设用地，用于建房。
遵守规划要求：
- 即使在农村地区，也存在特定的土地利用规划和村庄规划。村民在建造住宅时，应当遵守这些规划，并依法申请宅基地使用权。如果规划中允许在特定地块上建房，且该地块已经依法转为建设用地，那么建房行为就是合法的。
三、建议与总结
- 严格遵守法律法规：为了维护土地管理秩序、保障粮食安全和促进农业可持续发展，我们应当严格遵守土地管理法律法规，不在耕地上进行非法建设活动。
- 依法申请审批手续：如有建房需求，应依法申请相关审批手续，并按照规划要求进行建设。通过合法的途径满足建房需求，既保护了个人权益，也维护了社会公共利益和法律秩序。
- 咨询专业律师：在涉及土地和房产问题时，由于法律条款复杂且地域性差异大，建议咨询专业律师以获取更具体、更准确的法律意见。不过，在这里你可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供针对性的法律建议。
总之，农村耕地被征用建房是否合法，取决于是否经过合法审批程序并符合相关规划要求。在没有合法审批和规划的情况下，擅自占用耕地建房是违法的行为，将受到法律的制裁。