赔偿协议达成后，是否由保险公司先赔付需分情况讨论，具体如下：

1. 若赔偿协议涉及保险责任范围且无争议
   在交通事故、医疗责任险等场景中，若赔偿协议明确约定由保险公司承担赔付责任（如交强险、商业三者险），且事故责任、损失金额等无争议，通常由保险公司直接向受害方赔付。此时需满足：

   • 协议内容符合保险合同条款；
     
   • 投保人已履行报案、提交理赔材料等义务；
     
   • 保险公司未提出免责事由（如酒驾、无证驾驶等）。
     示例：车主A与行人B达成赔偿协议，约定由A的保险公司赔偿B的医疗费、误工费，此时保险公司需按协议赔付。

2. 若赔偿协议涉及非保险责任或存在争议

   • 非保险责任部分：若赔偿金额超出保险限额（如交强险医疗费限额1.8万元），或协议中包含保险合同明确免责的项目（如精神损害抚慰金），超出部分需由责任方自行承担。
     
   • 争议情形：若保险公司对事故责任、损失金额有异议（如怀疑伤者过度治疗），可能拒绝赔付或要求通过诉讼解决，此时需先通过协商、鉴定或诉讼明确责任后，再由保险公司按判决结果赔付。
     示例：车主A与行人B协议赔偿20万元，但A的交强险仅能赔付12万元，剩余8万元需由A自行承担。

3. 特殊场景：代位求偿权
   在财产保险中（如车损险），若事故由第三方造成，被保险人可先要求保险公司赔付，再由保险公司向第三方追偿。此时保险公司会优先赔付，但被保险人需配合提供追偿所需材料（如事故认定书、对方信息等）。

行动建议：

• 签订赔偿协议前，建议先与保险公司确认赔偿项目及金额是否在保险范围内；
  
• 若保险公司拒赔或部分拒赔，可要求其出具书面拒赔通知，并保留协议、事故证据等材料；
  
• 涉及复杂争议时，可进一步向我咨询具体处理方案。