邻居房顶长出野生树，可先尝试与邻居协商，若协商不成，根据树的归属及影响情况，可找物业、社区、城管部门或通过法律途径处理。具体分析如下：

1. 尝试与邻居协商：

   • 房顶属于邻居的私人空间，首先建议与邻居友好沟通，说明树可能对房屋结构、排水等造成的影响，共同商讨解决方案，如邻居自行清理或双方共同承担清理费用等。

2. 联系物业或社区：

   • 如果协商无果，且你们居住在有物业管理的小区，可以联系物业。物业有责任维护小区的公共环境和安全，可能会协助处理或提供建议。
   • 若没有物业或物业无法解决问题，可以向所在社区反映情况。社区工作人员可以介入调解，促进双方达成一致。

3. 向城管部门反映：

   • 如果树已经对房屋安全或公共环境造成了严重影响，且邻居拒绝处理，可以向当地的城市管理综合执法部门（城管）反映。城管部门有权对影响城市容貌和环境卫生的行为进行查处，包括清理房顶的野生树。

4. 法律途径：

   • 如果上述方法均无法解决问题，且树的存在已经严重侵犯了你的合法权益（如房屋安全、采光等），可以考虑通过法律途径解决。可以咨询律师，了解具体的法律程序和维权方式，如提起相邻权纠纷诉讼等。