结论：公司按最低基数缴纳公积金是否合法，需分情况讨论，具体如下：

1. 若当地公积金缴存基数下限低于最低工资标准，且公司按最低基数（不低于下限）缴纳，则合法
   根据《住房公积金管理条例》第十六条，职工住房公积金的月缴存额为职工本人上一年度月平均工资乘以缴存比例。但各地会制定具体的缴存基数上下限（通常为当地社平工资的60%-300%）。若当地规定的缴存基数下限低于最低工资标准，公司按最低基数（不低于下限）缴纳公积金，属于合法操作。例如，某地社平工资为8000元，下限为4800元（60%），若最低工资标准为2200元，公司按4800元缴纳合法。

2. 若当地公积金缴存基数下限高于最低工资标准，公司仍按最低工资标准缴纳，则违法
   若当地规定的公积金缴存基数下限（如社平工资的60%）高于最低工资标准，公司必须按不低于下限的基数缴纳。例如，某地社平工资为8000元，下限为4800元，最低工资标准为2200元，公司若按2200元缴纳，则违反《住房公积金管理条例》及地方规定，可能面临补缴、罚款等法律责任。

3. 若公司未按职工实际工资缴纳，即使高于下限也可能违法
   即使当地缴存基数下限较低，若职工实际工资高于下限，公司仍应按职工上一年度月平均工资（不超过上限）缴纳。例如，职工月工资为10000元，当地下限为4800元，公司若按4800元缴纳，则属于未足额缴纳，职工可要求补缴差额。

建议：

• 职工可登录当地住房公积金管理中心官网，查询缴存基数上下限及个人缴存明细；
  
• 若发现公司违法缴纳，可向当地公积金管理中心投诉（需提供劳动合同、工资流水等证据）；
  
• 公司若想规避风险，应严格按职工实际工资（不超过上限）及地方规定确定缴存基数。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作或地方政策差异。