如果被税务局认定存在虚开发票（即虚开虚抵）的行为，这确实是一个需要严肃对待的问题，因为虚开发票不仅违反了税收法律法规，还可能带来严重的法律后果。以下是我为您详细梳理的处理步骤和建议：
一、深刻认识虚开发票的严重性与后果
虚开发票是一种严重的违法行为，它破坏了税收的公平性和公正性，损害了国家的税收利益。根据《中华人民共和国会计法》和《中华人民共和国刑法》的相关规定，虚开发票可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等，甚至可能构成犯罪，面临有期徒刑、拘役等刑事处罚。因此，一旦被税务局认定存在虚开发票行为，必须高度重视，并积极配合税务机关的调查。
二、详细了解认定情况并收集证据
主动沟通：首先，应及时与作出认定的税务机关进行详细沟通，了解关于虚开发票认定的具体信息，包括发票明细、交易情况、法律依据等。这有助于您更准确地了解问题的严重性和税务机关的认定依据。
全面审查：接下来，组织企业内部相关部门对涉及的发票及交易进行全面梳理，收集能够证明交易真实性、合法性的各类证据。这些证据可能包括合同协议、货物运输单据、资金往来凭证、出入库记录等。这些证据将有助于您在后续的调查和申辩中证明自己的清白或减轻责任。
三、核实情况并积极配合调查
申辩与核实：如果发现被查出的虚开发票是误报或误判，应及时向税务机关提供相关证据进行申辩，并请求核实。在申辩过程中，要保持冷静和理性，以事实为依据，以法律为准绳。
如实说明：如果确实存在虚开发票的行为，应如实向税务机关说明情况，主动配合调查，并提供与虚开发票相关的所有资料。隐瞒或谎报只会加重您的法律责任。
四、申请听证与陈述申辩
申请听证：按照税务机关规定的程序和期限，书面申请听证。听证是一个重要的法律程序，它允许您在专业人士的协助下，向税务机关清晰阐述交易的实际情况，提出自己的观点和证据。
提交材料：以书面形式向税务机关详细说明企业对认定虚开发票的看法和意见，提供支持交易真实合法的证据，并对税务机关认定过程中可能存在的错误进行分析和说明。这些材料将有助于税务机关更全面地了解情况，作出更公正的认定。
五、寻求专业法律帮助
在处理虚开发票问题时，寻求专业法律帮助是至关重要的。您可以尽快聘请专业的税务律师和税务师介入。税务律师能够提供全面的法律分析，制定合理的应对策略，并与税务机关进行沟通和协商；税务师则能对涉及的税务问题进行专业审查和分析，提供税务处理方面的专业意见。他们的专业知识和经验将为您的案件处理提供有力支持。
六、采取补救措施并加强内部管理
补救措施：对于已经虚开的发票，应尽快采取补救措施，如补开真实发票、更正错误发票等，以减少损失，并向税务机关报告实施情况。这些补救措施有助于减轻您的法律责任，并展示您积极改正的态度。
内部整改：加强内部管理，完善发票管理制度和流程，确保发票的真实性和合法性。同时，开展税务合规培训，提高员工的法律意识和合规意识。通过内部整改，您可以防止类似问题再次发生，并提升企业的整体合规水平。
七、考虑行政复议或行政诉讼
行政复议：如果对税务机关的认定结果不服，可以在规定期限内向上一级税务机关申请行政复议。在申请行政复议时，要明确指出问题并提供充分证据，以支持自己的观点。
行政诉讼：若行政复议结果仍不满意，可以在法定期限内向有管辖权的人民法院提起行政诉讼。通过司法途径争取公正裁决是您的合法权利，也是维护自身权益的重要手段。
综上所述，处理虚开发票问题需要您保持冷静和理性，积极配合税务机关的调查，并采取一系列有效的措施来应对。在整个过程中，寻求专业法律帮助是至关重要的。希望这些建议能对您有所帮助。