农村个人自建房劳动合同电子版在符合法定条件时有效。具体分析如下：

1. 电子合同的法律效力基础
   根据《中华人民共和国民法典》第四百六十九条及《中华人民共和国电子签名法》第三条，电子合同与书面合同具有同等法律效力，但需满足以下条件：
   

• 真实意思表示：合同内容需体现双方真实意愿，无欺诈、胁迫等情形；
  
• 内容合法性：合同条款不得违反法律、行政法规的强制性规定（如农村自建房需符合《土地管理法》《城乡规划法》中关于宅基地使用、建设审批的规定）；
  
• 电子签名合法性：若合同需签名，应使用可靠电子签名（如符合《电子签名法》第十三条规定的数字证书签名），或双方明确认可的其他电子形式签名。

1. 农村自建房合同的特殊要求
   农村自建房涉及宅基地使用权、建设规划许可等行政审批事项，合同效力需结合以下因素判断：
   

• 主体资格：承包方需具备相应施工资质（如《建筑业企业资质标准》中规定的房屋建筑工程总承包资质），否则可能因违反《建筑法》第二十六条导致合同无效；
  
• 审批手续：若自建房未取得乡村建设规划许可证或宅基地使用权证，合同可能因标的违法而无效；
  
• 内容合规性：合同需明确约定工程范围、质量标准、工期、价款支付方式等核心条款，避免因约定不明引发纠纷。

1. 电子版合同的实践建议
   

• 证据固定：通过邮件、短信或第三方电子合同平台签署，保留签署时间、IP地址等元数据，增强证据效力；
  
• 公证或见证：对重要合同可申请公证或邀请村委会见证，提升可信度；
  
• 纸质备份：建议同步签署纸质合同，或在电子合同中约定“双方确认电子版与纸质版具有同等效力”。

风险提示：若合同涉及宅基地买卖、超面积建设等违法行为，或承包方无资质施工导致安全事故，即使采用电子形式签署，合同仍可能被认定无效，且需承担行政处罚或民事赔偿责任。

如有具体合同条款或纠纷场景，可进一步提供细节，我将结合地方性法规为您分析。