代理商被取消代理后，员工的问题需从多个角度进行分析和处理，具体如下：
员工与代理商的劳动关系：
- 劳动关系存续：若员工与代理商之间存在正式的劳动合同关系，且代理商被取消代理资格并不直接导致劳动合同的终止或无效，那么员工与代理商之间的劳动关系原则上仍然存续。此时，代理商应继续履行劳动合同中的义务，包括支付工资、提供社会保险等。
- 劳动合同变更或解除：若因代理商被取消代理资格导致原劳动合同无法继续履行（如业务范围变化、工作地点变更等），代理商应与员工协商变更劳动合同内容或解除劳动合同。若双方协商一致解除劳动合同，代理商应按照法律规定支付经济补偿金。
- 经济补偿金计算：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，经济补偿金按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
员工与上游公司的关系：
- 直接雇佣：若员工实际上是由上游公司直接雇佣，但以代理商的名义进行工作（如挂靠、借名等），则代理商被取消代理资格后，员工与上游公司之间的劳动关系可能不受影响。此时，员工应直接与上游公司沟通，明确劳动关系及后续工作安排。
- 无直接关系：若员工与上游公司之间无直接劳动关系，仅因代理商的代理资格而与上游公司产生业务联系，则代理商被取消代理资格后，员工与上游公司之间无直接法律义务。员工应关注与代理商之间的劳动关系处理。
代理商的义务与责任：
- 通知义务：代理商在得知被取消代理资格后，应及时通知员工，并说明后续处理方案。这有助于员工及时了解情况，做出合理决策。
- 合法处理：代理商在处理员工问题时，应遵守相关法律法规，不得侵犯员工的合法权益。如违法解除劳动合同、拖欠工资等，将可能面临法律责任。
员工权益保护：
- 协商与调解：员工在面临代理商被取消代理资格的情况时，应首先尝试与代理商进行协商，寻求合理解决方案。若协商无果，可寻求工会、劳动调解组织等第三方机构的帮助进行调解。
- 法律途径：若协商和调解均无法解决问题，员工可通过法律途径维护自身权益。如向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或向人民法院提起诉讼等。
建议：
- 对于员工而言，应保留好与代理商之间的劳动合同、工资支付记录等证据材料，以便在需要时维护自身权益。
- 对于代理商而言，应妥善处理与员工之间的劳动关系问题，避免引发不必要的法律纠纷和声誉损失。
- 在处理此类问题时，建议双方保持冷静和理性，通过合法途径寻求解决方案。
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