在再审过程中，如果发现事实不清、证据不足，处理方式会根据案件类型（刑事、民事、行政）的不同而有所差异。以下是对各类案件中相关处理方式的详细分析：
刑事案件
疑罪从无原则：在刑事案件中，若再审发现事实不清、证据不足，应遵循疑罪从无的原则。这意味着，如果证据不足以证明被告人有罪，法院应作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。
具体处理阶段：
- 侦查阶段：若公安机关在侦查过程中发现案件事实不清、证据不足，且犯罪嫌疑人不应追究刑事责任，应撤销案件，释放犯罪嫌疑人，并通知原批准逮捕的人民检察院。
- 审查起诉阶段：人民检察院对于需要补充侦查的案件，可退回公安机关或自行侦查，补充侦查以二次为限。若二次补充侦查后仍认为证据不足，不符合起诉条件，应作出不起诉决定。
- 审判阶段：在再审过程中，若法院认为证据不足，不能认定被告人有罪，应作出无罪判决。
民事案件
谁主张，谁举证原则：在民事案件中，若再审发现事实不清、证据不足，法院将根据谁主张、谁举证的原则进行处理。
具体处理方式：
- 原告举证不足：若原告无法提供充分证据证明其主张，法院可能驳回原告的诉讼请求。例如，在民间借贷纠纷中，原告仅凭借条但无法证明款项已实际交付，法院可能不会支持其还款诉求。
- 被告举证不足：若被告提出反驳或抗辩但无足够证据支持，法院可能不采纳其观点，进而支持原告合理的诉求。
- 法院决定：若法院认为案件事实不清、证据不足，也可能根据具体情况决定不予受理、驳回起诉或要求当事人补充证据。
行政案件
行政机关负举证责任原则：在行政案件中，若再审发现事实不清、证据不足，且该不足证据涉及行政机关行政行为的合法性，法院将判决行政机关败诉。
具体处理方式：
- 被告举证不足：若行政机关无法提供充分证据证明其行政行为的合法性，法院将判决行政机关败诉，并可能撤销或部分撤销行政行为，要求被告重新作出行政行为。
- 原告举证部分情形：在特定情况下，如起诉被告不履行法定职责的案件，原告也需承担举证责任。若原告举证不足，可能承担不利的判决结果。
综合建议
- 补充证据：在再审过程中，如果发现事实不清、证据不足，当事人应积极补充证据，以支持自己的主张或反驳对方的主张。
- 咨询专业意见：面对复杂的法律问题，当事人可以向我咨询，我会根据案件的具体情况和法律规定，为当事人提供有针对性的法律策略和建议。
- 尊重法院判决：无论再审结果如何，当事人都应尊重法院的判决，并按照判决履行自己的义务。如果对判决有异议，可以在法定期限内提出上诉或申请再审。
在再审过程中，面对事实不清、证据不足的情况，当事人应保持冷静，积极补充证据，并咨询专业律师以获取具体的法律建议和帮助。我会根据案件的具体情况，为当事人提供全面的法律支持。