双方签订的无经济纠纷协议，在符合法律规定的情况下是有效的。不过，其有效性及具体影响还需从多个角度进行详细分析：
一、协议的有效性条件
双方真实意思表示：协议必须是双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。如果一方在签订协议时受到欺诈或胁迫，那么该协议可能因缺乏真实意思表示而被认定为无效。
内容合法合规：协议内容必须合法，不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗。如果协议内容涉及非法活动或违反社会公共利益，那么该协议将被认定为无效。
形式要件：虽然大多数合同并不要求特定的形式，但某些特定类型的合同（如涉及不动产的买卖合同）可能需要满足特定的形式要件（如书面形式、登记等）才能生效。不过，对于一般的无经济纠纷协议，通常并不要求特定的形式。
二、协议的具体影响
对双方权利义务的明确：无经济纠纷协议可以明确双方在经济往来中的权利和义务，避免未来可能出现的纠纷。例如，双方可以约定在协议签订后，不再就之前的经济往来提出任何异议或要求。
对诉讼时效的影响：如果协议中明确约定了双方放弃对彼此的经济权利主张，那么这可能构成对诉讼时效的放弃或中断。不过，这需要根据具体协议内容和相关法律规定进行综合判断。
对第三方的影响：无经济纠纷协议通常只对签订协议的双方具有约束力，对第三方不产生直接影响。但是，如果协议内容涉及第三方的利益或权利，那么可能需要第三方的同意或参与才能生效。
三、可能存在的风险及防范
协议内容不明确：如果协议内容表述模糊或存在歧义，那么可能导致双方对协议的理解产生分歧，进而引发纠纷。因此，在签订协议时，应尽可能明确、具体地表述双方的权利和义务。
一方违约：即使签订了无经济纠纷协议，也不能完全排除一方违约的可能性。如果一方违约，另一方可能需要通过法律途径来维护自己的权益。因此，在签订协议时，可以考虑约定违约责任和争议解决方式等条款。
法律变化：法律是不断变化的，如果协议签订后相关法律发生了变化，那么可能影响协议的效力或履行。因此，在签订协议时，应尽可能考虑法律变化的可能性，并约定相应的应对措施。
建议：在签订无经济纠纷协议前，双方应充分了解协议的内容和法律后果，确保协议符合法律规定且双方真实意思表示。如有需要，可以寻求专业律师的帮助来起草或审查协议内容。如果在协议履行过程中出现任何问题或纠纷，也可以随时向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。