关于农村宅基地和宅基地间小隔道流下水管卫生间水是否合法的问题，这主要取决于多个因素，包括当地的具体规定、是否侵犯他人权益以及是否符合环保和卫生要求等。以下是从不同角度进行的分析：
当地规定与规划：
- 农村宅基地的使用和管理通常受到当地政府或相关部门的规划和监管。首先，需要查阅当地关于宅基地使用、排水设施建设等方面的具体规定。
- 如果当地规定允许在宅基地间设置排水设施，并且该设施符合相关规划和标准，那么流下水管卫生间水可能是合法的。
是否侵犯他人权益：
- 即使当地规定允许设置排水设施，也需要确保该设施不会侵犯相邻宅基地使用人的合法权益。例如，排水设施不应导致相邻宅基地积水、潮湿或产生异味等问题。
- 如果排水设施的设置对相邻宅基地使用人造成了实际损害或不便，那么可能构成侵权，需要承担相应的法律责任。
环保和卫生要求：
- 排水设施的设置还需要符合环保和卫生要求。例如，卫生间水应经过适当的处理后再排放，以避免对环境造成污染。
- 如果排水设施不符合环保和卫生标准，可能会受到相关部门的处罚，并需要承担整改责任。
针对您的情况，我建议采取以下措施：
- 查阅当地规定：首先，查阅当地关于宅基地使用、排水设施建设等方面的具体规定，了解是否允许在宅基地间设置排水设施以及具体的设置要求。
- 与相邻宅基地使用人协商：如果计划设置排水设施，建议与相邻宅基地使用人进行协商，确保不会侵犯其合法权益，并达成共识。
- 确保符合环保和卫生标准：在设置排水设施时，应确保符合环保和卫生标准，避免对环境造成污染。
- 咨询相关部门：如果仍有疑问或不确定如何操作，建议咨询当地政府或相关部门（如城乡规划部门、环保部门等），以获取更具体的指导和建议。
最后，需要强调的是，农村宅基地和排水设施的设置涉及多个方面的法律问题，如果处理不当可能会引发纠纷或承担法律责任。因此，在操作前务必进行充分的了解和咨询，确保合法合规。如果您有任何进一步的疑问或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。