针对您提出的“同一笔款注明还甲方，后来变成还乙方了怎么办”的问题，这通常涉及到合同履行过程中的变更问题，以下是从不同角度的分析和建议：

1. 合同变更的合法性：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同一旦成立，对当事人具有法律约束力。当事人协商一致，可以变更合同。因此，如果款项的还款对象从甲方变更为乙方，必须基于双方当事人的真实意思表示，并且达成了一致的变更协议。
   • 分析：若变更未经双方协商一致，或者存在欺诈、胁迫等情形，导致变更协议无效或可撤销，那么原合同（即注明还甲方的合同）仍然有效，应按照原合同履行。

2. 证据收集与证明：

   • 关键点：在处理此类纠纷时，证据的收集与证明至关重要。您需要收集所有与款项支付、合同变更相关的证据，如转账记录、聊天记录、书面变更协议等。
   • 分析：这些证据将有助于证明款项的实际支付情况、合同变更的过程以及双方的真实意思表示。如果无法提供充分证据支持变更的合法性，那么可能面临按照原合同履行的风险。

3. 可能的法律后果：

   • 若变更合法有效：如果双方确实协商一致变更了还款对象，并且变更协议合法有效，那么您应按照变更后的协议履行还款义务，即向乙方还款。
   • 若变更无效或可撤销：如果变更协议存在无效或可撤销的情形，如未经双方协商一致、存在欺诈或胁迫等，那么原合同仍然有效。此时，您应继续按照原合同履行还款义务，即向甲方还款。如果已经向乙方还款，可能面临向甲方再次还款的风险，并可能需要承担违约责任。

4. 建议与行动：

   • 协商解决：首先，我建议您与对方进行协商，尝试达成一致意见，明确款项的还款对象。如果能够通过协商解决问题，将是最为高效和经济的途径。
   • 法律途径：如果协商无果，您可以考虑通过法律途径解决纠纷。这包括向法院提起诉讼或申请仲裁等。在诉讼或仲裁过程中，您需要提供充分证据支持自己的主张，并遵循法律程序进行。

在处理此类纠纷时，请务必保持冷静和理性，避免采取过激行为或言语。同时，建议您及时咨询专业律师（即我本人，王胜利律师，专注于刑事辩护、合同纠纷领域），以获取更具体和专业的法律建议。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。