结论：车站人员扣停营运车辆的行为是否违法，需根据具体情况判断，包括扣停行为的合法性依据、扣停程序是否合法以及扣停后的处理方式等。以下从这几个方面进行详细分析：
扣停行为的合法性依据：
- 车站人员并非执法机关，一般情况下，他们无权直接扣停营运车辆。但如果车站有明确的规章制度，且该制度符合相关法律法规的规定，同时营运车辆确实违反了这些规定（如没有进站手续强行进站），车站人员可能依据内部规定采取一定的管理措施。然而，这种管理措施通常应是限制车辆进出或要求车辆补办手续等，而非直接扣停车辆。
- 若车站人员扣停车辆的行为缺乏明确的合法性依据，或者该依据与法律法规相冲突，则这种扣停行为可能是违法的。
扣停程序是否合法：
- 即使车站有扣停车辆的合法性依据，也必须遵循合法的程序。例如，车站人员应出示相关证件或文件，说明扣停的原因和依据，并告知车主或驾驶员有权进行申诉或寻求法律援助。
- 如果车站人员在扣停车辆时未遵循合法程序，如未出示证件、未说明原因或未告知权利等，则这种扣停行为可能构成程序违法。
扣停后的处理方式：
- 车站人员在扣停车辆后，应及时与相关部门（如交通管理部门）联系，将车辆移交至合法场所进行进一步处理。同时，应确保车主或驾驶员的合法权益不受侵害，如提供必要的饮食、住宿等条件（在合理范围内）。
- 如果车站人员在扣停车辆后未采取合理措施处理车辆或未保障车主或驾驶员的合法权益，则可能构成对合法权益的侵害，需要承担相应的法律责任。
法律建议：
- 对于车主或驾驶员而言，如果认为车站人员的扣停行为违法或侵犯了自己的合法权益，可以收集相关证据（如现场照片、视频、证人证言等），并向当地交通管理部门或公安机关报案或投诉。
- 同时，也可以考虑通过法律途径维护自己的权益，如向法院提起诉讼要求赔偿损失等。
可能的法律后果：
- 如果车站人员的扣停行为被认定为违法或侵犯了车主或驾驶员的合法权益，他们可能需要承担行政责任（如罚款、警告等）或民事责任（如赔偿损失等）。
- 在极端情况下，如果扣停行为导致了严重的后果（如人员伤亡、财产损失等），车站人员还可能面临刑事责任的追究。
综上所述，车站人员扣停营运车辆的行为是否违法需根据具体情况判断。如果您或他人遇到了类似情况，建议直接向我咨询以获取更具体的法律建议。