在处理同一违法行为涉及两个违法主体的案件合议时，确实需要分别发表意见。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
法律程序的要求：
- 在法律程序中，每个违法主体都是独立的诉讼参与人，他们有权就案件事实、法律适用及自身责任等问题发表意见。
- 分别发表意见有助于确保每个违法主体的诉讼权利得到充分保障，避免因为合并发表意见而导致的权利忽视或剥夺。
案件事实的复杂性：
- 同一违法行为可能涉及多个违法主体，但每个主体在违法行为中的角色、行为及责任可能各不相同。
- 分别发表意见有助于合议庭更全面地了解案件事实，准确判断每个违法主体的责任大小，从而作出公正的裁决。
法律适用的准确性：
- 不同的违法主体可能因行为性质、主观故意等因素而适用不同的法律条款或承担不同的法律责任。
- 分别发表意见有助于合议庭更准确地适用法律，确保每个违法主体都受到与其违法行为相适应的法律制裁。
实践操作的便利性：
- 在案件合议过程中，分别发表意见可以使得合议庭成员更清晰地了解每个违法主体的立场和观点，便于进行有针对性的讨论和辩论。
- 这也有助于提高合议效率，确保案件能够及时、公正地得到处理。
具体操作建议：
- 在案件合议前，合议庭可以要求每个违法主体准备书面意见，就案件事实、法律适用及自身责任等问题进行详细阐述。
- 在合议过程中，合议庭可以依次听取每个违法主体的口头意见，并进行必要的询问和辩论。
- 合议庭成员在合议过程中应保持独立、客观的态度，对每个违法主体的意见进行认真分析和评估，确保裁决的公正性和准确性。
可能遇到的特殊情况及处理：
- 如果两个违法主体在违法行为中的角色、行为及责任高度相似，合议庭可以考虑在听取意见后进行合并讨论，但最终裁决仍应分别针对每个违法主体作出。
- 如果某个违法主体在合议过程中拒绝发表意见或无法发表意见（如因失踪、死亡等原因），合议庭应根据已有证据和法律规定进行裁决，并说明理由。
综上所述，分别发表意见在处理同一违法行为涉及两个违法主体的案件合议中是必要的，它有助于保障诉讼权利、全面了解案件事实、准确适用法律及提高合议效率。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。