私自扣发工资是否违法，需根据具体情况来判断，但总体而言，无正当理由的私自扣款是违法的。以下从不同角度为您详细分析：
一、违法情况
违反《中华人民共和国劳动法》：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。若公司无故或未经法定程序扣减员工工资，即构成违法。
随意制定罚款制度：
- 公司不能以员工上班迟到、未穿工作服等轻微违规为由进行罚款，除非这些罚款已在劳动合同中明确约定，并经过民主程序制定相关规章制度。否则，这种私自扣款行为将违反法律规定。
以经营困难为由单方面扣工资：
- 公司经营不善时，不能单方面决定降低员工工资或克扣工资，这侵犯了劳动者获得劳动报酬的权利，属于违法行为。
二、合法情况
尽管私自扣发工资通常违法，但也存在一些特定情况下公司可以依法扣减员工工资的情形：
代扣代缴必要费用：
- 公司可以依法从员工工资中代扣以下费用：个人所得税；应由员工个人负担的各项社会保险费用；法院判决裁定中要求代扣的抚养费、赡养费等。这些代扣行为是基于法律规定的，因此是合法的。
赔偿经济损失：
- 如果员工因个人原因给用人单位造成经济损失，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但需注意以下几点：
- 赔偿金额可从劳动者本人的工资中扣除；
- 每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%；
- 扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。
三、劳动者权益保护
如果劳动者认为公司扣减工资不合理或违法，可以采取以下措施维护自己的权益：
与用人单位协商：
- 首先尝试与公司进行沟通，了解扣款的具体原因，并提出自己的异议。这是解决问题的第一步，也是最为直接和高效的方式。
向劳动监察部门投诉：
- 若协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。劳动监察部门将对用人单位进行调查，如发现违法行为，将责令其改正并可能给予相应处罚。
法律途径维权：
- 在必要时，劳动者可以提起劳动仲裁或诉讼，通过法律手段来维护自己的合法权益。根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十条的规定，用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令。
四、法律后果
如果公司私自扣发工资被认定为违法，将可能面临以下法律后果：
- 责令限期支付：劳动保障行政部门将责令用人单位限期支付劳动者的工资报酬。
- 加付赔偿金：逾期不支付的，责令用人单位按照应付金额50％以上1倍以下的标准计算，向劳动者加付赔偿金。
- 其他行政处罚：根据具体情况，用人单位还可能面临其他行政处罚，如警告、罚款等。
总结来说，私自扣发工资是否违法需根据具体情况判断。劳动者应了解自己的权益和公司的扣款依据，以便在必要时采取适当的措施来保护自己的合法权益。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。