分公司注销后，其欠总公司的借款原则上仍需偿还。分公司作为总公司的分支机构，不具备独立法人资格，其民事责任由总公司承担。但在分公司注销的情境下，借款的偿还问题需结合具体情况，从以下几个角度进行分析：

一、债权债务关系的确认

1. 审查借款合同：首先，应仔细审查分公司与总公司之间的借款合同或相关协议，明确借款金额、期限、利率及还款方式等关键条款。这是确认债权债务关系的基础。
2. 确认债务存在：通过财务记录、银行流水等证据材料，进一步确认分公司确实存在对总公司的未偿还借款。这些证据材料是后续追讨借款的重要依据。

二、分公司清算情况的影响

1. 清算程序合规性：分公司在注销前应依法进行清算，清算过程需合法合规。清算组应全面清理公司财产、编制资产负债表和财产清单，并通知债权人申报债权。若清算程序存在瑕疵，可能影响借款的偿还。
2. 剩余财产分配：在清偿完所有债务后，若分公司仍有剩余财产，应按照法定顺序进行分配。但在此情况下，由于分公司欠总公司借款，该笔债务应优先得到偿还。若分公司财产不足以清偿全部债务，总公司可能需按比例受偿或面临无法全额受偿的风险。

三、还款计划的制定与执行

1. 协商还款方案：总公司可与分公司的清算组或相关负责人协商，制定切实可行的还款计划。考虑到分公司已注销，实际还款责任可能由分公司的原股东或上级单位（即总公司）承担。但在此情境下，更可能是通过分公司的剩余财产或清算所得来偿还借款。
2. 执行还款义务：根据还款计划，相关责任方应按时履行还款义务。若无法一次性还清全部借款，可协商分期偿还或采取其他合理方式解决。

四、法律途径的追讨

1. 发送催款函：若相关责任方未按约定履行还款义务，总公司可向其发送催款函，要求其在限定期限内还清欠款。这是追讨借款的初步法律手段。
2. 提起诉讼：若催款无果，总公司有权向法院提起诉讼，要求相关责任方承担还款责任。在诉讼过程中，需提供充分的证据证明债权债务关系的存在及分公司的清算情况。
3. 申请强制执行：若法院判决支持总公司的诉讼请求，而相关责任方仍拒不履行还款义务，总公司可向法院申请强制执行，通过变卖其财产等方式实现债权。

五、特殊情况的处理

1. 分公司财产不足以清偿债务：若分公司财产在清算后不足以清偿全部债务，总公司可能需按比例受偿或面临无法全额受偿的风险。在此情况下，总公司可考虑与分公司的其他债权人协商，寻求更合理的债务解决方案。
2. 分公司未依法清算即注销：若分公司未依法进行清算即注销，总公司可依法追究相关责任人的法律责任，并要求其承担借款的偿还责任。

六、注意事项

1. 保留证据材料：在处理此类问题时，务必妥善保管好所有相关的合同、财务记录、银行流水等证据材料，以备不时之需。
2. 关注诉讼时效：注意诉讼时效问题，确保在法律规定的期限内主张权利。一般来说，诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。

总结与建议：分公司注销后欠总公司的借款原则上仍需偿还，但具体偿还方式需结合分公司的清算情况、剩余财产状况以及相关法律法规的规定来确定。建议总公司在处理此类问题时，及时咨询专业律师（即我本人）的意见，以确保自身权益得到充分保障。