轻伤二级案件在调解后检察院仍然起诉，可能的原因主要有以下几点：

1. 调解协议未完全履行或存在争议：

   • 尽管双方达成了调解协议，但如果一方未按照协议内容履行义务，比如未支付赔偿金、未履行道歉等承诺，另一方可能会向检察院反映情况，要求继续追究刑事责任。
   • 另外，如果调解协议本身存在争议，比如赔偿金额、赔偿方式等条款不明确或存在歧义，也可能导致检察院认为案件尚未得到妥善解决，从而决定起诉。

2. 检察院认为案件性质严重或社会影响恶劣：

   • 检察院在审查案件时，会综合考虑案件的性质、情节以及社会影响等因素。如果检察院认为轻伤二级案件虽然调解了，但案件性质严重，比如涉及故意伤害、寻衅滋事等恶劣行为，或者社会影响恶劣，如引发公众广泛关注或造成不良社会后果，那么检察院可能会决定起诉，以维护社会公正和法治秩序。

3. 调解过程存在违法或不当行为：

   • 如果在调解过程中存在违法或不当行为，比如调解员偏袒一方、强迫调解等，导致调解结果不公正或不合理，那么受害方可能会向检察院提出异议，要求重新审查案件。在这种情况下，检察院可能会认为调解过程存在问题，从而决定起诉。

4. 检察院的独立判断与监督职能：

   • 检察院作为国家的法律监督机关，具有独立的判断权和监督职能。即使双方已经达成调解协议，检察院仍然有权对案件进行审查，并根据法律规定和案件实际情况决定是否起诉。这是检察院履行法律监督职责、维护社会公正和法治秩序的重要体现。

针对您的情况，我建议您：

• 了解调解协议的具体内容：确认双方是否已经完全履行了调解协议中的各项义务，以及是否存在任何争议或不明确的地方。
• 与检察院沟通：如果您对检察院的起诉决定有疑问或不满，可以主动与检察院沟通，了解他们起诉的具体原因和依据，以便更好地应对和解决。
• 寻求法律帮助：如果您在处理此类案件时遇到法律难题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况和法律规定，为您提供专业的法律意见和帮助。

最后，需要强调的是，每个案件都有其独特性和复杂性，检察院的起诉决定也是基于多种因素的综合考虑。因此，在面对此类情况时，保持冷静和理性，积极寻求法律帮助，是解决问题的关键。