行政复议机关审查行政协议的时间规定，通常遵循《中华人民共和国行政复议法》中的相关条款，具体审查期限一般为六十日，但存在一些特殊情况。以下是对这一问题的详细解答：
一般审查期限：
- 根据《中华人民共和国行政复议法》的相关规定，行政复议机关在受理行政复议申请后，应当在六十日内作出行政复议决定。这一期限同样适用于对行政协议的审查，因为行政协议作为行政行为的一种形式，其审查过程也需遵循行政复议的基本程序。
特殊情况下的审查期限延长：
- 如果行政复议机关认为情况复杂，不能在六十日内作出行政复议决定的，经行政复议机关的负责人批准，可以适当延长，但延长期限最多不超过三十日。这意味着，在特殊情况下，行政协议的审查期限可能延长至九十日。
审查期限的计算与中断：
- 审查期限通常从行政复议机关受理行政复议申请之日起计算。如果行政复议申请材料不齐全或者表述不清楚，行政复议机关可以自收到该行政复议申请之日起五日内书面通知申请人补正，补正申请材料所用时间不计入行政复议审理期限。
- 此外，如果行政复议期间涉及对具体行政行为的依据进行审查，或者需要第三方机构进行鉴定、评估等，这些程序所需时间也不计入行政复议审理期限。
审查期限的法律后果：
- 如果行政复议机关未在法定期限内作出行政复议决定，申请人有权依法向人民法院提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。同时，行政复议机关也可能因超期未决而面临相应的法律责任和监督。
举例说明：
假设某市民对市政府与其签订的行政协议存在争议，认为市政府违反了协议中的某些条款。该市民依法向行政复议机关提出了行政复议申请。行政复议机关在受理申请后，按照法定程序进行了审查。如果审查过程顺利，没有遇到需要延长或中断审查期限的情况，那么行政复议机关应当在六十日内作出行政复议决定。如果情况复杂，需要延长审查期限，那么经行政复议机关负责人批准后，可以延长至九十日。
建议：
- 如果您作为行政协议的当事人，对行政复议机关的审查期限有疑问或担忧，建议及时与行政复议机关沟通，了解审查进展情况。
- 如果您认为行政复议机关未在法定期限内作出决定，或者对决定结果不满意，可以依法向人民法院提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
如有其他关于行政复议或行政协议的法律问题，欢迎直接向我咨询。